| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5130084 = | 77 (0.320) | 15 (0.080) | 6/222 | NT | 17.6% | intergenic (+61/‑121) | PP_4511/PP_4512 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
| ? | NC_002947 | 5130163 = | 78 (0.400) | intergenic (+140/‑42) | PP_4511/PP_4512 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
ATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCGGCGCAC > NC_002947/5129935‑5130232 | ataGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCT < 2:1066543‑M1/150‑1 (MQ=255) taGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTT < 1:5030784‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTC > 1:3812025‑M1/1‑150 (MQ=255) gCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCG > 1:2859451‑M1/1‑150 (MQ=255) gCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCG > 1:5168143‑M1/1‑150 (MQ=255) tgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTcgc > 2:4229653‑M1/146‑150 (MQ=255) cGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGG < 1:1142845‑M1/150‑1 (MQ=255) atcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCgg > 1:2720475‑M1/144‑150 (MQ=255) atcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCgg > 1:1350789‑M1/144‑150 (MQ=255) tcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCggg < 1:25224‑M1/8‑1 (MQ=255) cAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTGTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGT > 1:3923862‑M1/1‑150 (MQ=255) cgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTaaa > 2:4556915‑M1/139‑150 (MQ=255) gggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAc < 2:5280630‑M1/13‑1 (MQ=255) gggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAc > 1:2188219‑M1/138‑150 (MQ=255) gggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAc > 2:4278477‑M1/138‑150 (MQ=255) gTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC < 2:358492‑M1/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC < 2:4053634‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACC < 1:862702‑M1/150‑1 (MQ=255) ctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCg > 1:5544752‑M1/135‑150 (MQ=255) ctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCg > 1:5285567‑M1/135‑150 (MQ=255) cTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:121933‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 2:4452559‑M1/150‑1 (MQ=255) ggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:3840996‑M1/133‑150 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCgc > 2:3791325‑M1/1‑148 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:1467900‑M1/150‑1 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:281380‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:3317107‑M1/132‑150 (MQ=255) ttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCgaa < 1:4027884‑M1/150‑4 (MQ=255) tCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCgaan < 1:3764194‑M1/150‑5 (MQ=255) gcggcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA > 2:640339‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGa < 1:1045915/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGc < 2:1895611/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGc < 1:5617941/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCt < 1:640339/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAt < 2:3126360/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAt < 2:945761/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAt < 2:4183275/150‑1 (MQ=255) ggTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAtgttg < 2:885990/150‑1 (MQ=255) 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tttGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcct > 1:661546‑M2/1‑147 (MQ=255) tttGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCTACACGATTCCCCCCCCGGAAAGTTGT‑GCAAAAcca < 2:2366686‑M2/150‑4 (MQ=255) tGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgt > 2:561860‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgt > 2:5058614‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgt > 1:4627410‑M2/1‑145 (MQ=255) ggCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgta > 1:793056‑M2/1‑144 (MQ=255) ggCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgta > 1:2320348‑M2/1‑144 (MQ=255) ggCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGAGAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgta > 2:4349823‑M2/1‑144 (MQ=255) agaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTa > 1:371737‑M1/92‑150 (MQ=255) gCTTTGCGGCGCGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAcctgtag > 2:4265258‑M2/1‑143 (MQ=255) 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(MQ=38) tGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:3061119‑M1/82‑1 (MQ=255) tGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTC > 2:3061119‑M1/1‑82 (MQ=255) tGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGGGAACCCCCGCCAACCGGGTGGCCCCGCCGGAAGGTTGT‑GCAAAACCGGGAGGCGCGGGGTTACCCGCCAGAGGGGCgg > 2:25224/1‑150 (MQ=255) agTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACGATGCCCCCCCCGGAATGTTGT‑GCAAAACCGGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGcc > 2:5006547/1‑150 (MQ=38) tCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGGTAACCCCCGCCGACACGCTGCCCCCCCCGGGAAGTTGTGGAAAAACCGGTGGGGCCGGGTTT‑CCCCCGGAATGGCCCGCCCTggcgg > 1:3579608/1‑146 (MQ=255) ttGCGAAAGAATTTGTTTGACTGAGGCTTTAAACTTTTCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAAACCCACCGAAACGATGCCCCCCCCAGAATTTTTT‑TCAAAAAAAGTATGTGAGGGTTTAAACCCCCAAGGGCCCGCCCTGCCAGTa > 2:3837749/1‑150 (MQ=255) gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCTGCCCCCGCCGGCATGTTGT‑GGCAAACCGGGAGGAGCGGGGGTTCCCGCGCCAGGGCCGGCACAGCCGGTagagt > 2:2909424/1‑149 (MQ=37) gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAtgtt > 1:2441468/1‑93 (MQ=255) gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAtgtt < 2:2441468/93‑1 (MQ=255) aCAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTACTACAGGCTGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTTGGCGCGGGGTTACCCGCGCAAGGGCCGGCCCTGCCTGgagagag > 2:3034362/1‑149 (MQ=255) cAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCAGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGAtc < 2:5168143/150‑1 (MQ=255) tttGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGATTCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAAACGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAg > 2:3679350/1‑150 (MQ=38) tgtggCTTTACACTTTGCGTTTGCCGGCCCGTTCGCGGGTAAACCCGATCCTACAGTATGCCCCCGCCTGATTGTTGT‑GCAATACCTTTAGGTGCGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACcca < 2:2256206/147‑1 (MQ=37) tGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAGGCTGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTGGGAGCGGGGGTAACCCCGAAAGGGCCCGCACTGCCAGTCGAGATATCCATCAAGGAcccc > 2:5456702/1‑149 (MQ=37) ggtggCTTTACACTTTGCCTTTGCGGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTATGGCCCCGCCTGATTTTTGT‑GCAAAACCTGTAGGTGGGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACcca < 2:2256172/147‑1 (MQ=38) ggCTTTAACCTTTGGCTTGGCGGGCCCCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCTACTGGTTGCCCCCGCCTGTTTGTTGT‑GAAAAACCTTTTGGTGGGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACccacca < 1:5006547/150‑1 (MQ=255) gCTTTAAAGTTTGGCTTTGCCGGCCCGTTCGCTGTTAAACCCGCTCCTCCTGGTTGCCCCCGCCTGATTTTTGT‑GAAAAACCTGTAGGTGGGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCAt < 1:2225885/150‑1 (MQ=255) ttACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCCCCTGAATTTTGT‑GCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCACCATCAAGGACCCACCAAGaa > 2:2809562/1‑150 (MQ=255) ttACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTAAAGGATTCCCCCGCCAGAATGTTGT‑GCAAAACCAGTAGGCGCGGGTTTAACCCCGAAAGGGCCCGCCCAGCCGGGAGAGAACTCCATCAACGCCCCACCAAGaa > 2:3614782/1‑150 (MQ=255) cacTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGCAAGGGCCGGCACAGCCGGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCAAGAaaca > 2:4034798/1‑150 (MQ=255) tttgcctttgccGGCCCCTTCGCGGGGCAAACCCCGCCGACCCGAAGCCCCCCCCCGGATGTTGT‑GCCAAACCGGGGGGGGCCGGGTTACCCCCGCAACGGCCGGCCCAGCCGGGAGAGATCTCCCAAAAGGGCCCACCAAGAcccaccc > 2:232846/1‑149 (MQ=255) tgcctttgcgGGCCCCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCGGTTGCCCCCGCCTTATTGTTGT‑GCAAAACCTGTAGGAGGGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACcaccgca < 2:1157720/150‑1 (MQ=38) ctttgccGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGCTGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCGGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGCAAGGGCCGGCACTGCCGGTAGAGGTCTCCATCAAGGACCCACCATGAAccaccccaccc > 2:4538847/1‑149 (MQ=38) cGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCAACAGGATGCCCCCCCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCGGTAGGAGCCGGTTTACCCCCGAAAGGGCCGGCACTGCCGGTAGATATAACCATAAAGGAACCACCAAGAACCACCCCACCGCCCACg > 2:4985131/1‑150 (MQ=255) ggCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCgg < 2:3906836/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCACCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCGGGAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACAGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCGGCGCAc > 2:1923238/1‑150 (MQ=255) | ATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGT‑GCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCGGCGCAC > NC_002947/5129935‑5130232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |