| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 594784 | 167 (0.690) | 12 (0.050) | 9/252 | NT | 6.8% | intergenic (‑20/+107) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 594847 | 173 (0.780) | intergenic (‑83/+44) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAG > NC_002947/594699‑594993 | cTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGt > 1:5304266‑M2/1‑149 (MQ=255)cTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGt > 2:3786034‑M2/1‑149 (MQ=255) cTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcc > 1:1180209‑M2/1‑146 (MQ=255) cTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTACGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGAGGGAGCGGGCGtgcc < 2:4291354‑M2/150‑5 (MQ=255) ttGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgccc < 1:1002626‑M2/150‑6 (MQ=255) tGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGGGGGAGCGGGCGtgcccg > 1:4776038‑M2/1‑144 (MQ=255) ggTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCAAGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCCGGCATG‑CCAGCTCCCACAGGTCCTGCACAAACTCCAAATCCTTCGGGGCTCCCTGTGGGAGCCGGCGtgcccgcg < 1:5000782‑M2/150‑9 (MQ=255) gggcggcCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCTTTGCCGGCCTCTTGGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGAGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGc < 2:2338041/149‑1 (MQ=255) ccttAGAGGCATCGCTACCAGCAACACCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTGGCGGGCAGG‑CCCGCTCCCACCGTTACTGCACAAGCTCAAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAAGCAGGCGGt < 1:1279287/147‑1 (MQ=255) aTAGAGGCATCGCTACCTGCACCAGAAAGGCCAGCTGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCCCAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGa < 2:5581999/150‑1 (MQ=38) tcgcggCAGCGCTACCAGCAACCGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCGGGCCTCTGCGCGGGCATG‑CCCGCGCCCCCCGGTCCGGCACACGCTCCAACGCCGGGGGGGCGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 2:3920074/146‑1 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt > 2:1897468/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt > 2:2174777/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt > 1:2319561/1‑150 (MQ=255) cctCGCTACCAGCAACCGCACGGCCAGCAGCTTGTGCTTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGG‑CCCGCGCCCACCGGACCGGCACACGCCCCAACGCCGGCGGGGCGCCCGGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGttt < 2:4810990/148‑1 (MQ=255) cATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCCGCTGCTTGTGCTTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCGCCCCCCGGTACTGCACAAGCTCCAACGCGTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGttt < 1:5114537/150‑1 (MQ=38) cATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTGCGGGGGAAGG‑CCCGCTCCCCCCGGTAGGGCCCACGCTCCAACGCCGGCGGGGCTCCCTGGGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGttt < 2:5242967/150‑1 (MQ=255) cATCGCAACCACCAACACCAAGGCCTGCTGCATGTGCATTGCCGGCCTCTCCGCGGGCAGG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACATGCTCCAAACCCTGCGGGGCTCCCTTTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGttt < 2:2566326/150‑1 (MQ=38) gCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATc > 2:3165689/1‑150 (MQ=255) cTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCa > 2:1540138/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCAtt > 2:5473763/1‑150 (MQ=255) agcaacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcg > 1:3862141/1‑150 (MQ=255) gcaacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcgc > 2:4399600/1‑150 (MQ=255) aaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCag > 2:3344769/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCAGATTGTGATTTGCCGGCCTCTTGGCGGGCTTG‑CCCGCTCCCACAGTTACTGCACAAGCTCAAACGCCTGCGGGGCTCCGTGTGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCagag < 2:1568016/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGgt < 2:787613/150‑1 (MQ=255) cagcaTGTGCATGGCCGGCCTGGTCGCGGGCAGG‑CCCGCTCCCACCGGTACTGCACACGCTCCACCGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTAt < 2:1625629/150‑1 (MQ=255) agcaTGTGCTTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAACGCCTGGGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATg < 2:2896940/150‑1 (MQ=255) caTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGa > 1:587476/1‑150 (MQ=255) gtgCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAg < 2:5548182/150‑1 (MQ=255) gggcctggCCGGCCTCTGGGGGGGCCGG‑CCCCCCCCCCCCGGAACTCCACACCCACCACCGCCTGGGGGGCTCCGTGGGGGCGGGGGGGGCCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAg < 1:2854730/143‑1 (MQ=255) tgCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGTGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGGGAGGGGTTTGATCATTACGCGCCCTCAGAGGTGTATGGACAgg > 1:3370834/1‑150 (MQ=255) gctttGCCGGCCTCTTGGCGGGCTTG‑CCGGCTCCCACTGGTACTGCACACGCTCCAAAGCCTGGGGGGCGCCCTTTGGGTGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGc < 2:1554614/147‑1 (MQ=255) attggcgggCCTCTGGGCGGG‑ATGCCCCGCCCCCACTGTTACTCCACACGCACAAACGCGGGGGGGGCTCCGTGTGGGCGGGGGGGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGcc < 1:5356838/143‑1 (MQ=255) aTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCg > 2:1758356/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCCTGTTCGGGGGCTTG‑CCCGCTCCCACCGGTACTGCACAAGCTCAAACGCCTGGGGGGCCCCCGGTGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTc < 2:21921/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTca > 1:3617520/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCACCCACAGGTAATGCACAAGCTCCAAAGCCAGCGGGGCAACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAAGCGCACTCAGAGGTTTATGGACAGGCCGTcagc > 1:1533049/1‑150 (MQ=38) cGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCCCTCCCACACGTACAGCACAAGCACCAAAGCCAGCGGGGCTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCCCAGCAGGCGGGGAGGGGTTTGATCAATAAGCGCACTCACAGGTGTATGGACAGGCCGTcagc > 1:9982/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCg > 1:3538112/1‑150 (MQ=255) ctTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGa > 2:4336519/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCCCAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt > 1:2959486/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt > 1:2156218/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAtt > 2:5082804/1‑150 (MQ=255) gcgGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGc > 2:2473455/1‑150 (MQ=255) cgGGCCTG‑CCCGCTCCCCCTGGTACTGCACAAGCTCCAACGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGcc < 1:2279033/150‑1 (MQ=255) gggCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg > 1:4408575/1‑150 (MQ=255) gggCAGG‑CCCGCTCCCACCGGTACTGCACAAGCCCCACCGCCGGGGGGGCGCCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 1:5479903/150‑1 (MQ=255) ggccATC‑CCCCCCCCCACAGTTACGGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 2:969493/147‑1 (MQ=255) gggccgccccGCCCCCACCGGTACGCCACACGCACCAACGCGGGGGGGGCCCCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 1:605258/143‑1 (MQ=255) cgg‑CCCGCGCCCCCCGGTCCGGCCCACGCCCCAACGCCGGGGGGGCCCCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTaa < 1:3431239/148‑1 (MQ=255) agg‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACACGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTaa < 2:3471195/148‑1 (MQ=255) aTG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcgaagaggccggcaatgcacatgctgctggccttgctgttgctggtagcgat > 2:3531138‑M2/1‑64 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcgaagaggccggcaatgcacatgctgctggccttgctgttgctggtagcgatgcctctatgggccgccgaacccaaggagctgg < 1:5444766‑M2/150‑91 (MQ=255) gCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcgaagaggccggcaatgcacatgctgctggccttgctgttgctggtagcgatgcctctatgggccgccgaacccaaggagctggac < 1:1420115‑M2/150‑93 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGcc < 2:1155232/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGAt < 2:2312688/87‑1 (MQ=255) cccACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCAc > 1:113879/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACg > 1:1726111/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACTGCACAAACTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcgaagaggccggcaatgcacatgctgctggccttgctgttgctggtagcgatgcctctatgggccgccgaacccaaggagctggactggc < 2:387092‑M2/150‑97 (MQ=255) cccaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc < 2:359734/148‑1 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGTCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGcc > 1:4340078/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGcc > 2:2954639/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAAGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGcc > 1:1909795/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcgaagcaggccggcaatgcacatgctgctggccttgctgttgctggtagcgatgcctctatgggccgccgaacccaaggagctggactggcccg < 1:1654788‑M2/150‑101 (MQ=255) aGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCgg > 2:2383240/1‑150 (MQ=255) gTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCa > 2:4687851/1‑150 (MQ=255) tGCACACGCTCAAACGCCTGGGGGGCGCCCTGTGGGCGGGGGCGGGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCt < 1:701357/150‑1 (MQ=255) cacaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGc > 2:4294114/1‑150 (MQ=255) cacaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGc > 2:5201089/1‑150 (MQ=255) cacccaccAACGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGccc < 1:1275482/144‑1 (MQ=255) gCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCCGCCCATc > 2:1797751/1‑150 (MQ=255) cTCCTACGCGTGCGGGGGTCGGTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCa < 2:3350093/150‑1 (MQ=255) cTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCa < 1:3668307/150‑1 (MQ=255) tCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATg > 1:3250262/1‑91 (MQ=255) tCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc > 1:2532204/1‑132 (MQ=255) tCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 1:4682380/1‑150 (MQ=255) tCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 2:1419139/1‑150 (MQ=255) ccAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGc > 1:488584/1‑150 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCa < 1:2383240/150‑1 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCa > 2:144081/1‑150 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCa > 2:4244867/1‑150 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCa > 1:4417764/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCaa > 2:412724/1‑150 (MQ=255) tGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGc > 2:3289125/1‑150 (MQ=255) ggggggCTCCGTGTGGGTGGGGGGGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGcc < 1:3955207/148‑1 (MQ=255) ggggCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGcccc > 1:2280174/1‑150 (MQ=255) taccTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAG‑AGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgat > 2:1999502/3‑150 (MQ=255) tCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGga < 1:418581/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGGGGGGGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatg < 1:1509456/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatg > 2:3688629/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatgat > 2:4935351/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatgat > 2:5398389/1‑150 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATa < 2:61656/150‑1 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATa < 2:2080813/150‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCaa > 1:4929601/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAg < 2:2132496/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAg < 2:2728923/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAg > 2:5162627/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAg < 1:3930106/150‑1 (MQ=255) | CTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATG‑CCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAG > NC_002947/594699‑594993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |