New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4850122 = | 129 (0.530) | 12 (0.060) | 9/242 | NT | 9.7% | intergenic (+14/‑123) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4850215 = | 109 (0.510) | intergenic (+107/‑30) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCC > NC_002947/4850066‑4850364 | gggTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCTACTGCGAGAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTc < 1:4654535/150‑1 (MQ=255) gggTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTc < 2:622311/150‑1 (MQ=255) gTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCt < 2:2181692/150‑1 (MQ=255) gTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCt < 2:4517940/150‑1 (MQ=255) cGAACCCCGCCACGGCGCCTACCACCAACTGTACAAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGAACGCTCCGGCAATTGTATTACCCGGTGTGCCGCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCt < 1:1889064/150‑1 (MQ=255) gAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCCCGCCCGCGAAAGCGATAGCACAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTAGCGGGCGCGCCCCCACCCACACGGTTTCCAATCTg > 2:3524244/1‑150 (MQ=255) tGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGCAAGCGGTAGCTCAGGCACAGGTATTTCCAGGTCTGACGCAATCGCGGGCGCGCCCGCAACCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGc > 2:555195/1‑150 (MQ=255) tGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGc < 2:2053388/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGACAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCAGTCGCGGGCGCGCCCGCACCCACAGGGTTTCCTAACTGCCAGAGCAgt > 2:4340561/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACCCCCCCGAAAGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTACAGGTATGACGCATTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACAGGGTTTCCTAAAAGCCTGAGCAgtg > 2:3980403/1‑150 (MQ=255) aaCACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAACGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCt < 1:3230955/150‑1 (MQ=255) acacCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTa < 2:5117922/150‑1 (MQ=255) cAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGAc < 2:1757852/150‑1 (MQ=255) cAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCCCGAATTCGATAGCTCAGGCCAATGTATTTACAGGTCTGACGCATTCGCGGGCCCGCCCCCTCCCACAGGGTTTCCAATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTAAGAc > 2:4060621/1‑150 (MQ=255) aGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCTAATGCTATAGCTCAGGAAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATGCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCaa < 1:4839924/150‑1 (MQ=255) gTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAAc < 2:3910367/150‑1 (MQ=255) aaCACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCCAAGGTAGTTCCAGGTCTGACGCCGTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGGTTCCTCTCTGCCTGAGCAGTGGCTGGCCTCTGACCCAACCGAcc > 2:2715062/1‑150 (MQ=255) cacCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAcccc < 2:4469922/150‑1 (MQ=255) 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cgcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctg < 2:1494479/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgc < 2:2621535/150‑1 (MQ=255) cgcgcCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACGGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGccc < 1:762609/150‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGc < 1:2173350‑M2/135‑1 (MQ=255) ctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTc < 1:5252298‑M2/139‑1 (MQ=255) tcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCa < 1:3782148‑M2/140‑1 (MQ=255) tcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCa < 2:3011154‑M2/140‑1 (MQ=255) tcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCa < 1:717354‑M2/140‑1 (MQ=255) acccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCGATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCa < 1:55056‑M2/140‑1 (MQ=255) ccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAgg > 1:1003287‑M2/9‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCTGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 1:1766179‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 2:403976‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc < 1:2882515‑M2/143‑1 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCCGCTGTCAGGc > 2:403769‑M2/8‑150 (MQ=255) gggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCACCCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTg < 2:4201945‑M2/147‑1 (MQ=255) gggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTg < 1:45072‑M2/147‑1 (MQ=255) tttCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGcc > 1:2207913/1‑150 (MQ=255) | GTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCC > NC_002947/4850066‑4850364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |