| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 86765 | 136 (0.690) | 13 (0.070) | 5/244 | NT | 9.6% | intergenic (‑48/+97) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 86824 | 125 (0.720) | intergenic (‑107/+38) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein | |||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTA > NC_002947/86618‑86913 | tGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAt < 2:603697/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGc < 2:3386138/150‑1 (MQ=255) cgccgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCGGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGcc > 1:3919387/1‑150 (MQ=255) gccgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGTGCATGccc > 1:4403295/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa > 1:521266/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa < 1:2442966/150‑1 (MQ=255) ggCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa < 2:755464/150‑1 (MQ=255) tACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCa < 1:79549/150‑1 (MQ=255) tACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCa > 1:1527193/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCaa < 2:4262093/150‑1 (MQ=255) cagcagGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAAcg > 1:2816640/1‑150 (MQ=255) gctggTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGTATCCAGGTGAGGAAGGGGAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATACACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGGCCTGTGGGTTCGGTCATGCCCGCGAAAAAGCCAActcg < 1:4022120/147‑1 (MQ=255) cagGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGt > 2:144548/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCtt < 2:1332309/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCtt < 2:4325448/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCtt < 2:25718/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTgg < 2:102480/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGc < 2:1497574/150‑1 (MQ=255) 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cGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGc < 1:173464/150‑1 (MQ=255) ggCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCCGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCCACGCGTTGCGGGGCACCGGCGTTGcc > 2:4351293/1‑150 (MQ=255) gCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCg < 2:3972449/150‑1 (MQ=255) gCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCAGCTTTGCCg < 1:2037407/150‑1 (MQ=255) ccGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTCAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgt < 2:409009/150‑1 (MQ=255) gATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCatgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttt < 2:1574241‑M1/150‑50 (MQ=255) gATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgtgt < 1:2128224/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTACAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTc < 2:4037735/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGAAGCCAGGTGAGGACGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACACTCCTTAAGGGGTCGCCAAACCCTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgc < 2:4364823‑M1/150‑54 (MQ=255) ggCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATTGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGACACCGGCAAAGCCGgtgccaag < 2:3690190/150‑6 (MQ=39) 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(MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTATGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTATGTGAGATTACAGTTTGGCttt > 2:3342014/1‑150 (MQ=255) caATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGGTGGTGTGTTGCTTTGTGAGGTTACAGTTTGGCTTTg > 1:1005778/1‑150 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGGTTTGTGTGATTACAGTTTGGCTTTGACGGcc > 1:3655054/1‑150 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGcc > 2:1721104/1‑150 (MQ=255) ggggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCa < 2:521266/150‑1 (MQ=255) ggggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCGTTGTGAGTTTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCa > 1:1874059/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg < 2:1687880/150‑1 (MQ=255) tCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGc > 2:4489399/1‑150 (MQ=255) gcGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGc < 1:631002/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCAt > 2:4413109/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGGGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCACGGCaac > 1:3155641/1‑148 (MQ=255) aaGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccacaggggttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctg < 1:2543180‑M2/150‑73 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgccct > 2:3876468‑M1/1‑15 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctccgacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttc < 2:3894952‑M1/150‑138 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttc < 2:1505921‑M1/150‑138 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCgg > 1:705089/1‑150 (MQ=255) ggtggGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaacgccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttc < 2:55024‑M1/149‑138 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcc > 1:408131‑M1/1‑12 (MQ=255) tgGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTGCAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGcc > 1:4486999/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctca > 1:4180935‑M1/1‑9 (MQ=255) gAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcac > 2:1699383‑M1/1‑8 (MQ=255) gAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTTGCTTTTACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCAtg > 1:4255980/1‑150 (MQ=255) aGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtgg < 1:3704787/150‑1 (MQ=255) gcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcacctggct > 2:1563122‑M1/1‑2 (MQ=255) gCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTa > 1:1018963/1‑150 (MQ=255) | TGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTA > NC_002947/86618‑86913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |