| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 3492850 | 170 (0.900) | coding (506/2637 nt) | clpV | protein ClpV1 | |||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
AGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCGTCAAGCAGA > NC_002947/3492670‑3492966 | aGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgct < 2:766306/150‑1 (MQ=255) ggATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctg > 2:423282/1‑150 (MQ=255) gATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgg > 2:98067/1‑150 (MQ=255) gATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgg > 2:2546586/1‑150 (MQ=255) gATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgg > 1:435737/1‑150 (MQ=255) gATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgg < 2:3645374/150‑1 (MQ=255) aTGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctggg < 1:2370645/150‑1 (MQ=255) tGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgggc < 1:3512053/150‑1 (MQ=255) tCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgggctg < 2:2778276/150‑1 (MQ=255) tCGAACATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgggctg < 2:3694445/150‑1 (MQ=255) cGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCgctgggctgg < 2:2475932/150‑1 (MQ=255) gACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGc < 1:3637891/150‑1 (MQ=255) cATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAg > 2:729219/1‑150 (MQ=255) ctCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCAGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGc < 2:471852/149‑1 (MQ=255) aTCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGc > 2:1904074/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCGTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGc < 2:2759735/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCgg < 2:2563951/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCgg < 2:2307475/150‑1 (MQ=255) 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tCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCCGCGGGCTGGCCTGCCTGGAc > 1:1751692/1‑150 (MQ=255) aCGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTc < 1:2703631‑M2/150‑2 (MQ=255) aCGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTc < 1:2551109‑M2/150‑2 (MQ=255) ggCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTcgg > 2:1390248‑M2/1‑147 (MQ=255) gCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGagtccaggcaggccagcccgctggccagcccagcggc < 1:3093775‑M1/150‑38 (MQ=255) 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gCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATcac < 1:3761376/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATcacc > 2:938600/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATcacc < 1:912714/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCAcgc < 2:4463066/150‑1 (MQ=255) cTTGTTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCAcgcg > 2:2397202/1‑150 (MQ=255) 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gCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGc < 1:4089529/150‑1 (MQ=255) gCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAA‑GTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCa > 2:852795/1‑150 (MQ=255) cACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATc < 1:1200711/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTcggcgccagtgagcacgtcgagcaaggccagcggcaagaccccggcgctggaccagtacacggtcaaccttacccaaagcgcccgcgaaggccgcatcgacccggtg < 1:2557894‑M2/150‑108 (MQ=255) aCTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCg > 2:4246953/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCg > 2:3546377/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCg > 2:4158378/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTcggcgctagtgagcacgtcgagcaaggccagcggcaagaccccggcgctggac > 2:961435‑M2/1‑42 (MQ=255) tGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCGTc > 1:2585001/1‑150 (MQ=255) tGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCGTc < 1:736796/150‑1 (MQ=255) gccgcTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCGTCAAGc < 1:1025683/150‑1 (MQ=255) cGagtccaggcaggccagcccgctggccagcccagcggcgccagtgagcacgtcgagcaaggccagcggcaagaccccggcgctggaccagtacacggtcaaccttacccaaagcgcccgcgaaggccgcatcgacccggtgctgggccg > 1:2210357‑M1/1‑2 (MQ=255) cGagtccaggcaggccagcccgctggccagcccagcggcgccagtgagcacgtcgagcaaggccagcggcaagaccccggcgctggaccagtacacggtcaaccttacccaaagcgcccgcgaaggccgcatcgacccggtgctgggccg > 2:789266‑M1/1‑2 (MQ=255) gagtccaggcaggccagcccgctggccagcccagcggcgccagtgagcacgtcgagcaaggccagcggcaagaccccggcgctggaccagtacacggtcaaccttacccaaagcgcccgcgaaggccgcatcgacccggtgctgggccgt < 2:61161‑M1/150‑150 (MQ=255) gagtccaggcaggccagcccgctggccagcccagcggcgccagtgagcacgtcgagcaaggccagcggcaagaccccggcgctggaccagtacacggtcaaccttacccaaagcgcccgcgaaggccgcatcgacccggtgctgggccgt < 1:3988909‑M1/150‑150 (MQ=255) | AGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAGCGCGGCAAGGTTCAGGCGCAGGTCATCGGCGTTGATTTTTTCCAGCTCCGGTGCCGAGGCGATCACCACGCGACGCAGTTCAGCATCGTCAAGCAGA > NC_002947/3492670‑3492966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |