| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4162841 | 198 (1.060) | coding (1182/1302 nt) | PP_3663 | GGDEF domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
CGGATCACCCACATGGGTTACATGAAAGCTCCCCCACCTAGGTGACTCGCTCACTGCCGGAGTTCAACCACCGCCCGCTCGAAAAACCGAATGCTGTCGCGCCCCCCACGTTTGGACTGGTACAACGCCACATCCCCCTGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCACTGCTCGCG > NC_002947/4162671‑4162967 | gATCACCCACATGGGTTACATGAAAGCTCCCCCACCTAGGTGACTCGCTCACTGCCGGAGTTCAACCACCGCCCGCTCGAAAAACCGAATGCTGTCGCGCCCCCCACGTTTGGACTGGTACAACGCCACATCCCCCTGCTCGATCAAc‑gc < 2:3491221/150‑1 (MQ=255) acaTGGGTTACATGAAAGCTCCCCCACCTAGGTGACTCGCTCACTGCCGGAGTTCAACCACCGCCCGCTCGAAAAACCGAATGCTGTCGCGCCCCCCACGTTTGGACTGGTACAACGCCACATCCCCCTGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGc < 1:2081181/150‑1 (MQ=255) gggTTACATGAAAGCTCCCCCACCTAGGTGACTCGCTCACTGCCGGAGTTCAACCACCGCCCGCTCGAAAAACCGAATGCTGTCGCGCCCCCCACGTTTGGACTGGTACAACGCCACATCCCCCTGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGc < 1:1434032/150‑1 (MQ=255) 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cTGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCtgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcgagtcacctaggtggg < 1:3530977‑M2/150‑117 (MQ=255) tGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCa < 2:1701034/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCa > 2:1117141/1‑150 (MQ=255) tGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCa < 2:3719376/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCAc > 1:2937863/1‑150 (MQ=255) cGATCAgccgccggcgagcctggcggcgttgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcgagtcacctaggtgggggagc > 1:2210361‑M1/1‑6 (MQ=255) gATCAgccgccggcgagcctggcggcgttgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcgagtcacctaggtgggggagct < 1:4352070‑M1/150‑146 (MQ=255) gATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCACTGCt > 1:4166754/1‑150 (MQ=255) tCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCtgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcga > 2:3859151‑M2/1‑26 (MQ=255) cAgccgccggcgagcctggcggcgttgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcgagtcacctaggtgggggagctttc < 1:3103782‑M1/150‑149 (MQ=255) cAgccgccggcgagcctggcggcgttgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcgagtcacctaggtgggggagctttc < 2:2216350‑M1/150‑149 (MQ=255) agccgccggcgagcctggcggcgttgatcgagcagggggatgtggcgttgtaccagtccaaacgtggggggcgcgacagcattcggtttttcgagcgggcggtggttgaactccggcagtgagcgagtcacctaggtgggggagctttca > 1:2363128‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGGATCACCCACATGGGTTACATGAAAGCTCCCCCACCTAGGTGACTCGCTCACTGCCGGAGTTCAACCACCGCCCGCTCGAAAAACCGAATGCTGTCGCGCCCCCCACGTTTGGACTGGTACAACGCCACATCCCCCTGCTCGATCAAC‑GCCGCCAGGCTCGCCGGCGGCTGATCGAACACGTTGGCACCAATGCTCAAGGTAACCGCCTGGGGCGTAGGCACAGTCTTGTCGGCGTACTGCTGGAACTGCTCACGCAGCCCACTCCCCAGTTCCATGACCCGTTCACTGCTCGCG > NC_002947/4162671‑4162967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |