New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
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tctTCGGGGGTAAacccgctcctacgtcgggaaccgccccttggcattacgcccactgtcggaacggggttacccgcgaagtggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatc < 2:2739708‑M1/150‑138 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatc > 1:977862‑M1/1‑13 (MQ=255) taggagcgggtttacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatc > 1:2694220‑M1/6‑13 (MQ=255) ggttcgCGGGTAAacccgccccaccctggggaaccgcgccctggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagcggccggcacaggcgccaaaaattcaactccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatc < 2:2740129‑M1/148‑138 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGta < 1:1215626‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGtact < 1:2429616‑M1/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgc > 2:3905694‑M1/1‑10 (MQ=255) tCGCGGGACACCCGGTCCCTACCGGGGGCTTACTGCCTGGGGGCGGGCCCCGTCGTTGGAGCGGCTCTCCCCGGGACGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGtacta < 1:3264562/150‑1 (MQ=255) TCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGtacta < 1:2983359‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcg < 1:3081782‑M1/150‑1 (MQ=255) gggTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgacgaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgc < 2:810410‑M2/150‑89 (MQ=255) ggTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcaccggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgca > 1:1536139‑M1/1‑5 (MQ=255) ggTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgca > 1:215053‑M1/1‑5 (MQ=255) GGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggcg < 1:2804470‑M1/150‑1 (MQ=255) gTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgcac > 1:1056922‑M1/1‑4 (MQ=255) GTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggcgg < 1:4303231‑M1/150‑1 (MQ=255) aacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgcacctg < 2:1857993‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAG > NC_002947/5515088‑5515386 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |