| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5521795 = | 173 (0.880) | 13 (0.070) | 10/256 | NT | 6.8% | intergenic (‑96/‑130) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
| ? | NC_002947 | 5521880 = | 195 (1.070) | intergenic (‑181/‑45) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease | |||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCCC > NC_002947/5521648‑5521943 | gaagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCt < 1:4008557‑M1/3‑1 (MQ=255) cGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCGGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCtt > 2:1831972/1‑150 (MQ=255) aagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCtt > 2:625147‑M1/147‑150 (MQ=255) aagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCtt < 2:4349957‑M1/4‑1 (MQ=255) gccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcg < 1:1986039‑M1/6‑1 (MQ=255) ccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgcaaagcagccccattc > 2:4070689‑M1/144‑145 (MQ=255) ccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatagggctgcaaagcagccccattc > 2:862806‑M1/144‑145 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg > 1:3022813‑M1/142‑150 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg > 2:765673‑M1/142‑150 (MQ=255) ccGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCgg > 1:2357399/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGc < 1:3656549/150‑1 (MQ=255) gCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt > 2:4159828/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt > 2:2019509/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt > 2:3431688/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt > 2:3431646/1‑150 (MQ=255) aGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTcc < 2:3950737/150‑1 (MQ=255) aGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTcc < 1:2019509/150‑1 (MQ=255) cgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTccc < 1:245665‑M1/15‑1 (MQ=255) gggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGAt < 2:2733043/150‑1 (MQ=255) gATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCt < 2:923442/150‑1 (MQ=255) cGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGcc > 1:664235/1‑150 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCa > 2:2681121/1‑150 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCa > 2:1770008/1‑150 (MQ=255) ggTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAGGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGc < 1:2244754/150‑1 (MQ=255) tttACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTGCCCGCTGCCAAAGGATGTTCGCCAGCCTcc > 1:2817949/1‑150 (MQ=255) gCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCtgt < 2:3807686/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCtgt < 1:2192063/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCtgt < 1:4063084/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcc < 1:1183004/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTATCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCCCACGATCTGCGCCACCCGCCAGGCCTGTGTATacc > 1:603064/1‑150 (MQ=255) tGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCGATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCGCCCCCCACCCCCAGGATCTGCGCCAGCCGCCAGGCCGGGGTATCCCCCg > 1:144525/1‑150 (MQ=255) cTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTa < 2:1114899/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAg > 2:559507/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGc < 2:489191/150‑1 (MQ=255) gatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCg > 1:4447333‑M1/82‑150 (MQ=255) ggTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCCGCCGCCCGGCCGGGGTATGCCCCCGAGGGGCggg > 1:3037370/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGtt < 1:127557/150‑1 (MQ=255) tCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCCGGCACCCCCCACCCACAAGAACTGCGCCCGCCACCACGGCAGTGTATCCCCCCGAGGCGCGGGtt > 1:1512146/1‑150 (MQ=255) gTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCCCACCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCACGCCTGTGTATACCCCGTAGGAGCGGGTTCAc > 1:2637305/1‑150 (MQ=255) tggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctgaaatggggctgccttgcaggCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCAcc > 1:3420386‑M1/74‑150 (MQ=255) tGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGGAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCAccc < 2:2290574/150‑1 (MQ=255) gTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCcg < 2:2177316/150‑1 (MQ=255) gTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCGCCAGGCCTGTGGATCCCCCGGAGGAGCGGGGTCACCcg > 2:4213013/1‑150 (MQ=255) tCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 2:3828432/150‑1 (MQ=255) cTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCcgcg > 2:2972447/1‑150 (MQ=255) ggATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATTCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 2:3608028/1‑150 (MQ=255) gagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAg > 1:252441‑M1/67‑150 (MQ=255) agggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgg > 1:381501‑M1/66‑150 (MQ=255) aGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGc < 1:1076023/150‑1 (MQ=255) aaGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt < 1:1358505/73‑1 (MQ=255) aaGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt > 2:1358505/1‑73 (MQ=255) gTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCCGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCa > 1:718263/1‑150 (MQ=255) tataGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCaa < 2:1843585/150‑1 (MQ=255) ataGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCaaa > 1:4329970/1‑150 (MQ=255) 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cagacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTcc < 2:1149850/150‑1 (MQ=255) cagacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTcc < 2:727141/150‑1 (MQ=255) cagacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCGCCCACCCGATCTGCGCCAGCCGCCCGGCCTGTGTATACCCCGGAGGGGCGGGTTCACCCGCGCAGGGCGGCAAAGCACcccccatcc > 1:158678/1‑145 (MQ=255) cgccgggtactcgctgggggcgggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGCGCGGGTTCCCCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa > 2:3656304‑M1/44‑150 (MQ=255) agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa > 2:3946334/1‑150 (MQ=255) agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCCCGCCCCCAGGATCGGCGCCCGCCGCCACGCCCGTGTATCCCCCCGAGGAGCCGGGTCACCCCCGCAGGGCTGCAAAGCACCCCCAATccc > 1:4168702/1‑149 (MQ=255) gacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAg < 1:3758581/150‑1 (MQ=255) acacTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGc > 2:3760889/1‑150 (MQ=255) cTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGcccc < 2:3497635/150‑1 (MQ=255) tCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATACCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGccccc > 2:1986039/1‑150 (MQ=255) 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aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 1:1831972/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCGCCCACAGGATCTGCGCCACCCGCCAGGCCAGTGTATCCCCCGTATGAGCGGGGTGACCCCCCAAGGGCTTCAAAGCAGCCCCCTTCCCCCCCCCAGcca > 1:870397/1‑148 (MQ=255) aCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTa > 2:2897475/1‑150 (MQ=255) aGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCCGCCGCCAGGCCTGTGTATCCCCCGGAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCCGCCCCCTTCCCGCCCCCAGCGAGTAcc > 2:2454441/1‑150 (MQ=38) aGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCCCACCCACCCGATCTGCGCCACCCCCCACGCCAGTGGATCCCCCGTAGGAGCGGGGTCCCCCCCCAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATACAACCCCCACCGAGAAcc > 1:3826439/1‑150 (MQ=25) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCCGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgct > 2:2602658/1‑150 (MQ=255) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCAGCGCCCGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGGAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGGGCTGCACACCAGCCCCAGTCCAGCCCCCCGCGAGTACCctgct > 2:2326162/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCACCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCACGCCTGTGTATACCCCCTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATCCAGCCCCCACCGAGTAACcagctg > 1:927836/1‑150 (MQ=38) cGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCa < 1:2619820/150‑1 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATg < 2:691814/150‑1 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATg > 2:2214877/1‑150 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGGGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCGGCTGCATg > 2:2817700/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCCGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCCTGAAc > 1:3722400/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCCGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCGGCTGCATGAACTAc > 2:2343878/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCCGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGGGCTGCCAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCGGCGGCATGAACTAc > 2:2343794/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTAc < 1:177230/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTAc < 1:2930502/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTAc < 2:2869648/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTAc < 1:498144/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCt < 1:3494109/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCt > 2:1424033/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCt > 2:1036035/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTc < 1:3876769/150‑1 (MQ=255) aGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCCGCCGCCACGCCTGTGTATACCCCGTAGGAGCGGGTTCAACCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCACCGAGTACCCAGCTGCAAGAACAACCAGTTacc > 1:3620167/1‑150 (MQ=37) aGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCCGCGAGTACCCTGCAGCGTGAACTACCTGTTccc > 2:3879429/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTccccc < 2:3338461/150‑1 (MQ=255) | CCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCCC > NC_002947/5521648‑5521943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |