| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 6021226 = | 105 (0.530) | 6 (0.040) | 4/230 | NT | 5.8% | intergenic (‑49/+96) | dadX/dadA‑II | alanine racemase/D‑amino acid:quinone oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 6021302 = | 107 (0.650) | intergenic (‑125/+20) | dadX/dadA‑II | alanine racemase/D‑amino acid:quinone oxidoreductase | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GCCTTGATCACGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATT > NC_002947/6021077‑6021375 | gCCTTGATCACGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCG > 2:121204‑M1/1‑150 (MQ=255) ttGATCACGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGG < 1:2559082‑M1/150‑1 (MQ=255) tCACGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTT < 2:2288948‑M1/150‑1 (MQ=255) tCACGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTT > 2:527601‑M1/1‑150 (MQ=255) cGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCC > 1:3279052‑M1/1‑150 (MQ=255) cgacctgattgcgcgcaagaagccgcagatcagtgccgaaggcctggatatctcccgttatggcaatagccgggaagtggccaagcacgggcaaagcgcgccggctcaccagcagtaacagcctgtgccggcccatttGCGGGCTTGccc < 1:1289677‑M1/12‑1 (MQ=255) gAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCT < 2:3731761‑M1/150‑1 (MQ=255) tgattgcgcgcaagaagccgcatatcagtgccgaaggccttgatatctcccgttatggcaatagccgtgaagtggccaagcacgggcaaagcgcgccggctcaccagcagtaacagcctgtgccggcccatttGCGGGCTTGCCCGCTcc > 2:589762‑M1/134‑150 (MQ=255) tgattgcgcgcaagaagccgcagatcagtgccgaaggcctggatatctcccgttatggcaatagccgggaagtggccaagcacgggcaaagcgcgccggctcaccagcagtaacagcctgtgccggcccatttGCGGGCAAGCccgcaaa > 2:450915‑M1/134‑147 (MQ=255) tgattgcgcgcaagaagccgcagatcagtgccgaaggcctggatatctcccgttatggcaatagccgggaagtggccaagcacgggcaaagcgcgccggctcaccagcagtaacagcctgtgccggcccatttGCGGGCAAGCccgcaaa > 2:506937‑M1/134‑147 (MQ=255) gggCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCC < 1:2513793‑M1/150‑1 (MQ=255) gggCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGCCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCC > 1:4068694‑M1/1‑150 (MQ=255) gCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA < 2:3474753‑M1/150‑1 (MQ=255) 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gtggtTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGgcgc < 2:4105795/150‑1 (MQ=255) gtTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCt > 2:4341333/1‑150 (MQ=255) ggtttGAATTGGGTGGTGGTTTTTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACAGGTCGGGCACTGGTTTCAAACGCGGTGGTGTTCGTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGc < 1:3295060/147‑1 (MQ=37) gTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGccc < 1:2988764/150‑1 (MQ=255) gAATTCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTg < 2:1036670/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCt > 2:1901964/1‑150 (MQ=255) GCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCCCACCATTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGGGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTAtt < 2:16097‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCCTTGATCACGGCGAGGGCTTTGGCACCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATT > NC_002947/6021077‑6021375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |