New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2238884 = | 83 (0.420) | 9 (0.050) | 5/244 | NT | 11.7% | intergenic (+14/+114) | uvrB/PP_1975 | uvrABC excinuclease protein B/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
? | NC_002947 | 2238975 = | 63 (0.360) | intergenic (+105/+23) | uvrB/PP_1975 | uvrABC excinuclease protein B/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GTGACGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCCTGC > NC_002947/2238827‑2239124 | gtgtCGAGATTGCGCAGCTGGGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGTAGCGGGGGGGGGGGCGTGTGGGTGGGGGCGTGCCCGCGAATAATTCATCGGGGTGGCTGGCTCCGGCTGCGCGGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGAc < 2:1102328/150‑1 (MQ=25) gccggaagggttgaaggctggggaagcccattgaggctattacagatcagatgcggtCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCGGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGAc > 1:1852062‑M1/58‑150 (MQ=255) tGACGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGAcc > 2:2341047/1‑150 (MQ=255) cGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCa > 2:1961366/1‑150 (MQ=255) cGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCa > 2:1961381/1‑150 (MQ=255) gagaTTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCat > 2:2007511/1‑150 (MQ=255) gaTTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGCGGGGGCGTGCCCGCTAAGAATTCACCGCGGTGGCGGGCACCGGCTGCGCGGGTGTGCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatct < 1:3207367/150‑1 (MQ=255) gccgCTGCGGGCGCGGTTGATCAGCAGCTGCCGCGGGGCGCGGGCCCTGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGACGACTTCACCGCGGGGGCTGGCCCGGGCGGCGCCGGTGTTCGCGGGCCGGCCCGCGCCCACAGGGACCGCatctgatctg < 2:7599/147‑1 (MQ=255) gcAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGAAATCAACGCGGCGGCGGGCACCCGCGGCGCCGGTGTTAGCGGGCAGGCCCCCTCCCACCGGGACCCCaactgatctg > 1:289058/1‑150 (MQ=25) aGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCAGATCTGTa > 2:3225235/1‑150 (MQ=255) gAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGAATTCAACCCGGTGGCTGGCACCCGCTGCGCCGGGGTTCGCGGGCATGCCCGCACCCACACGGACCCCATCAGATCTGTAATAGccac > 1:289839/1‑148 (MQ=25) gTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGGGCGGGCGTGCCCCCGGAGAAATCAACGCGGTGGCGGGCCCCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCCGGCCCGCGCCCCCACGGACCGCATCTGGTCTGTAATAGCCGCAAAgg > 1:3606921/1‑150 (MQ=21) ttGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCACAATggg > 1:2998376/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCAGCTGACGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCCCCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGc < 1:299260/150‑1 (MQ=255) agcagcTGTCGCGGGGCGGGGGCCGTGTGGGCGCGGGGGTGCCCGCGATGAATTCAACGCGGGGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTGGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTccc < 1:3508685/150‑1 (MQ=25) gcgGGCCGTGTGGGTGGGGGCGTGCCCGCGATTAATTCACCGGGGTGGGTGGCCCCGGGTGCGCGGGTGTTGGCGGGAATGCCCGCTCCAAAAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTcc < 1:399107/150‑1 (MQ=255) gcgGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCACCGCGGTGGCGGGCACCGGCTGCGCCGGTGGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTcc < 1:4438538/150‑1 (MQ=255) gcgGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTcc < 1:1428455/150‑1 (MQ=255) 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GGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCgg > 2:1278226‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGt < 1:481573‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTc < 2:370609‑M1/150‑1 (MQ=255) gcatgcccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggCCCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcagca > 1:1002266‑M2/78‑150 (MQ=255) gcatgcccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcagca > 1:205772‑M2/78‑150 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcagca < 2:3361192‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCAcc < 2:289839/150‑1 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 2:3684425‑M2/72‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 2:4047530‑M2/72‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 2:1098117‑M2/72‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 1:3263791‑M2/72‑150 (MQ=255) ccGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 2:7488/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 2:2837849/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGc > 1:1702488/1‑150 (MQ=255) gcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcatgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGcc > 2:3426242‑M2/70‑150 (MQ=255) 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aTGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTaa > 2:3049050/1‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGcc > 2:1272231‑M2/16‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGcc > 2:3864323‑M2/16‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGcc > 2:3864331‑M2/16‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGcc > 2:3864396‑M2/16‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa < 1:3050719‑M2/136‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa > 1:670297‑M2/15‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa < 1:884757‑M2/136‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa < 1:3153233‑M2/136‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa < 1:3153109‑M2/136‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa < 1:3051082‑M2/136‑1 (MQ=255) ctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGa < 2:2406127‑M2/139‑1 (MQ=255) ccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCa > 2:4035865‑M2/9‑150 (MQ=255) cacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAg < 2:15569‑M2/143‑1 (MQ=255) acagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAgc > 1:637778‑M2/7‑150 (MQ=255) acagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAgc > 1:1565161‑M2/7‑150 (MQ=255) gggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGcc > 1:3340964‑M2/4‑150 (MQ=255) ggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCCt > 2:1257153‑M2/3‑150 (MQ=255) ggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCCt < 1:2837849‑M2/148‑1 (MQ=255) gACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCCTg > 1:2016974‑M2/2‑150 (MQ=255) gACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCCTg > 2:1858227‑M2/2‑150 (MQ=255) aCCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCctgc > 2:4180496/1‑150 (MQ=255) | GTGACGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGCCTGC > NC_002947/2238827‑2239124 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |