New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4579766 = | 158 (0.800) | 16 (0.080) | 9/266 | NT | 9.8% | intergenic (+9/+100) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | NC_002947 | 4579851 = | 143 (0.750) | intergenic (+94/+15) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
ATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGCATACAGCTCGGC > NC_002947/4579702‑4580000 | tggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtctcccgcgaaagggcca < 2:4267997‑M2/1‑1 (MQ=255) ggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa > 1:4510906‑M1/65‑150 (MQ=255) ggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa > 1:1172491‑M1/65‑150 (MQ=255) aaTGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACa > 1:2949567/1‑150 (MQ=255) aaTGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACa < 1:2241394/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAg > 1:3467739/1‑150 (MQ=255) tGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGc > 2:1414310/1‑150 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAAc > 1:1252936/1‑150 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAAc < 1:1262837/150‑1 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAAc > 1:3747492/1‑150 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACACGCTCCAACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAAc > 1:1528627/1‑150 (MQ=255) gAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCg > 1:1706382/1‑150 (MQ=255) gggTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCa > 2:2755444/1‑150 (MQ=255) gggTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCa < 1:3291895/150‑1 (MQ=255) ttGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGc < 2:474016/150‑1 (MQ=255) aTTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCggg > 2:4180869/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCt > 2:3860039/1‑150 (MQ=255) gCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTc < 2:3051800/150‑1 (MQ=255) 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tCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTc > 2:3534712/1‑150 (MQ=255) ccgccgGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACt < 1:2498665/150‑1 (MQ=255) ccgccgGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACt < 2:1788745/150‑1 (MQ=255) cgccgGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTg < 1:4211549/150‑1 (MQ=255) cgccgGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTg < 1:549476/150‑1 (MQ=255) gggTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCa < 2:1845548/150‑1 (MQ=255) gggTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCa > 2:3614478/1‑150 (MQ=255) gtgcggtgcCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTc < 1:1326870/69‑1 (MQ=255) gtgcggtgcCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTc > 2:1326870/1‑69 (MQ=255) ggtgcCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTc < 2:2410189/133‑1 (MQ=255) ggtgcCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTc > 1:2410189/1‑133 (MQ=255) gcCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCga < 2:4193263/150‑1 (MQ=255) cTGCGTAGGAACGGGTCTCCCACGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCa > 1:1029377/1‑85 (MQ=255) tGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGAt > 2:884468/1‑150 (MQ=255) tGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGAt > 2:1483845/1‑150 (MQ=255) tGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGAt > 2:1483416/1‑150 (MQ=255) cGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTg < 2:2249903/150‑1 (MQ=255) gTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGc > 1:3836194/1‑150 (MQ=255) tAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGcc < 2:1247319/150‑1 (MQ=255) gAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGAc > 2:4517826/1‑150 (MQ=255) ggTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCg > 1:2036810/1‑150 (MQ=255) gTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGa > 2:556005/1‑150 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGc < 2:2864387/150‑1 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGc > 2:2574436/1‑150 (MQ=255) ggccAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGCATACAGCt > 1:142729‑M2/5‑150 (MQ=255) cAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGCATACAGCTCgg > 1:1206265‑M2/2‑150 (MQ=255) aGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGCATACAGCTCGGc < 1:90389/150‑1 (MQ=255) | ATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTGGCCACTTCGTCACTGGCCACCGCCCCGAGATTGCCGACATTCGACCCGGCATACAGCTCGGC > NC_002947/4579702‑4580000 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |