| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5290364 = | 61 (0.310) | 6 (0.040) | 3/216 | NT | 10.5% | intergenic (‑75/+109) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B |
| ? | NC_002947 | 5290458 = | 55 (0.360) | intergenic (‑169/+15) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTG‑TGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGC > NC_002947/5290313‑5290604 | gCAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGGTTGCCCGCTCGCACAATTAGTGGAAAGTGGTTTTAAACTGGGTAATTACTG‑GGGGAGGGGGGAAGGCCGGGAAGAGGGGGGTag > 2:2100908/1‑149 (MQ=255) cAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGGGTGCCCGCGCCCCCCAGGACGGCAAAGTCCATGGAAACCGCGGAATAACAG‑TGGGAGCGGGCCACCCCCCGGAGACGCCGGGAcc > 1:1346400/1‑149 (MQ=255) cAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCAAAAATACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGGAATACCTG‑TGGGAGCGGGCAAACCCGCGAAGAGGCCGGTACa > 2:440587/1‑150 (MQ=255) cAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCCCCAGGACGGCCAACTCCGTGGAACCGGCGTAAAAACTG‑TGTGGGCCGGCCAGCCCCCCAAGAGGCCggggca > 1:2741862/1‑146 (MQ=255) ctgATTAGATCACCGCTTGTCTCGGCCACGGCCAGCGGCGCCTGTTTGGGCCTCTCGGGGGGCTTCCCGGCTCCCAAACTTACTGAAAAGTCCTTGAAACCTGC‑TAATTCCGGTTGGTTGCGGGAAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGa < 2:1662140/148‑1 (MQ=255) gtttAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCTGGGGCGCCTGTAGGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAATTACTGCAACGTCCTTTAAACCTGCTTAATACCTG‑TGGGAGCGGGCAAGTCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACa < 2:605570/148‑1 (MQ=38) gATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCGCTGCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGTAACCTGGGTAATACCTG‑TGGGTGCGGGGAAGCCCGCGTAGAGGCCGGTACAGACCTgaaa > 2:3593565/1‑150 (MQ=255) aaCCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCCCTCCCACAAGTAAAGCAAAATGCTTGAAAACAGCGTAATAACTG‑TGGGAGCGGGCAAGCCCGCGCAGAGGCCCGTAAAGACAAAAAATTa > 2:1243822/1‑150 (MQ=37) ccGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGGTTGCCCGCTCCCACATGTACTGCAACGTCCTTTAAACCTGCTTAATACCTG‑TTGGAGCGGGAAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACt < 2:4019465/150‑1 (MQ=38) tGTCGAGGCCACGACAAGCGGGGCCTTTTTGGGCCTCTGCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACATGTACTGAAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTG‑TGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGcc < 2:3070531/150‑1 (MQ=37) tCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGTCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTG‑TGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACCTAAAATTAATGTGCCtt > 2:612384/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTAGGGGCCTCGACGCGGGCTGGCCCGCTCCCACACGTACTGCAACGTCATTGAACCCGGCTTAATACCTG‑GGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTg < 2:3256639/150‑1 (MQ=38) aaGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACATCAAAGTGCTTGTAAACCGCGTAAAACCTG‑TGGGCGCGGGGCAGCCCGCGAAGCGGCCGGTGCAGACATAAAAATACTGTGGCTTGCCCAaca > 2:3887090/1‑150 (MQ=25) 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cccccgcgcagaggccGGTACAGACATCACATTACTGTGCCTTGCCAAACCCCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACCTCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCa < 1:3879770‑M2/134‑1 (MQ=255) agcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCa > 2:3709809‑M2/17‑150 (MQ=255) gcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAg > 2:416314‑M2/16‑150 (MQ=255) gcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAg > 2:2480913‑M2/16‑150 (MQ=255) cccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAgg > 1:3486715‑M2/15‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa > 1:1662107‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa > 2:2278516‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa > 1:2435873‑M2/14‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGaa > 2:4412419‑M2/13‑150 (MQ=255) aagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTgg < 2:2741862‑M2/142‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 1:9198‑M2/144‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 1:1235900‑M2/144‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 2:3035004‑M2/144‑1 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGc > 1:666215‑M2/4‑150 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGc > 1:2340603‑M2/4‑150 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCAGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGACGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGc > 1:1531318‑M2/4‑150 (MQ=255) | GCAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTG‑TGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGC > NC_002947/5290313‑5290604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |