New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 6177773 = | 233 (1.180) | 3 (0.020) | 3/266 | NT | 1.3% | coding (802/1377 nt) | atpD | ATP synthase subunit beta |
? | NC_002947 | 6177808 = | 229 (1.210) | coding (767/1377 nt) | atpD | ATP synthase subunit beta | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
ACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGTTCATCT > NC_002947/6177659‑6177955 | aCGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCcagca < 1:886384/150‑1 (MQ=255) gtcggtcAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGc < 1:2342867/150‑1 (MQ=255) tcggtcAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCg > 1:3429942/1‑150 (MQ=255) tcggtcAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCg < 2:4419721/150‑1 (MQ=255) tcggtcAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCg > 1:2264358/1‑150 (MQ=255) cAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATAc < 2:3057052/150‑1 (MQ=255) aaGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACt > 2:366487/1‑150 (MQ=255) tcCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTa < 2:192756/150‑1 (MQ=255) tcCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGAGCGGATACTTCGGtc > 2:396065/1‑149 (MQ=255) aCGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAgg > 2:697096/1‑150 (MQ=255) gTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGgt < 2:655300/150‑1 (MQ=255) aCGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTaa > 2:4172598/1‑150 (MQ=255) gCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGa < 2:1556742/150‑1 (MQ=255) cTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATa > 2:3724844/1‑150 (MQ=255) cTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATa < 2:3633830/150‑1 (MQ=255) tGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAg < 2:428471/150‑1 (MQ=255) gTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGa < 2:875126/150‑1 (MQ=255) gTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGa < 1:145628/150‑1 (MQ=255) 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tCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTcgacga > 2:2238026/1‑150 (MQ=255) tCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTcgacga > 2:1407558/1‑150 (MQ=255) cGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGaa < 1:107403/150‑1 (MQ=255) aaCCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAAca < 2:2955895/150‑1 (MQ=255) aaCCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAAca > 2:1172723/1‑150 (MQ=255) 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1:1099201‑M1/150‑1 (MQ=255) tAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGc < 1:2793523/150‑1 (MQ=255) cTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGAc > 1:1210065/1‑150 (MQ=255) cTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGAc > 1:2570640/1‑150 (MQ=255) cTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGAc < 2:2010217/150‑1 (MQ=255) tACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACg > 1:1567508/1‑150 (MQ=255) 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gAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCt > 2:2401808/1‑150 (MQ=255) aaGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCtg < 2:3256958/150‑1 (MQ=255) aGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCtgg < 1:3155410/150‑1 (MQ=255) aTACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGc < 1:3579760/150‑1 (MQ=255) aTACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGc > 2:779822/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGt > 1:4516019/1‑150 (MQ=255) cccAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGTTc > 2:4055176/1‑150 (MQ=255) ccagcAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGTTCa > 1:863009‑M2/6‑150 (MQ=255) agcAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTCACGATAGATGTTGTCGACGAACCGCAGACCGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGCCGGTTTCCTGGTGGCTCGTTCATc < 1:1239545‑M2/147‑1 (MQ=255) agcAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGTTCATc > 1:4271642‑M2/4‑150 (MQ=255) gcAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGTTCATCt < 1:1638974‑M2/148‑1 (MQ=255) | ACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAACCTTCCTTGGTGGAGGTGATGCGCTCTTGCAGAACGCCCATCTCTTCAGCCAGGGTCGGCTGGTAACCTACTGCCGAAGGCATACGGCCCAGCAGTGCGGATACTTCGGTACCGGCCAGGGTGTAACGATAGATGTTGTCGACGAACAGCAGAACGTCGTTACCTTCGTCACGGAACTTCTCGGCCATGGTCAGGCCGGTCAGCGCTACACGCAGACGGTTTCCTGGTGGCTCGTTCATCT > NC_002947/6177659‑6177955 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |