New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 744926 = | NA (NA) | 347 (0.910) | 151/290 | 0.6 | 93.4% | intergenic (‑588/+43) | PP_0636/PP_0637 | cold shock DNA‑binding domain‑containing protein/transposase |
? | NC_002947 | 2556010 = | 25 (0.060) | coding (26/1881 nt) | PP_2240 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
Only 100 of 412 total aligned reads displayed.
CTATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTac‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745074‑744926 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCCG > NC_002947/2556010‑2556159 caggACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTA > 2:3834365/5‑150 caggACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTA > 1:762118/5‑150 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TCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCAC > 1:6785277/1‑150 CCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACC < 1:6872440/150‑1 GTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCA < 2:4741529/150‑1 GTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCA < 1:6962875/150‑1 GTGGGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCAC > 2:764789/1‑150 TGGGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACT > 1:5714567/1‑150 GGGTTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGC > 2:625177/1‑150 TTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGC < 1:7447579/150‑1 TTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGC > 1:6516386/1‑150 TTCATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGC < 2:6834658/150‑1 ATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGC > 2:335485/1‑150 ATGGATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGC > 2:3144084/1‑150 GATCGGTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAGGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAAC < 1:2005115/150‑1 GTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGG < 1:7795035/150‑1 GTTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGG > 1:3569942/1‑150 TTACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGC > 1:4727501/1‑150 TACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCC > 2:7902850/1‑150 TACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCC > 2:2042426/1‑150 ACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCCG > 1:5351070/1‑150 ACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCCG > 2:5249039/1‑150 CTATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTac‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745074‑744926 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCCG > NC_002947/2556010‑2556159 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |