| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 2556010 = | 25 (0.060) | coding (26/1881 nt) | PP_2240 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 785 total aligned reads displayed.
TGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTGGTGGGCAAAAAAACTGGAACTGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCCG > NC_002947/2555861‑2556159 | tGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTGGTGGGCAAAAAAACTGGAACTGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGa < 2:6063354/150‑1 (MQ=255)ctatacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggtta < 1:371768‑M2/1‑1 (MQ=255)caggacgtggcgcagccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggtta > 1:7979908‑M2/150‑150 (MQ=255) tatacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttAc < 2:5066661‑M2/2‑1 (MQ=255) tatacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttAc > 2:6597550‑M2/149‑150 (MQ=255) aggacgtggcgcagccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttAc > 2:5217518‑M2/149‑150 (MQ=255) cAGGTAGGGGTTTTGTCTTTGGTGGGCAAAAAAACTGGAACTGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACa < 2:3965282/150‑1 (MQ=255) atacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACa < 2:8222742‑M2/3‑1 (MQ=255) atacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACa < 1:6277508‑M2/3‑1 (MQ=255) tAGGGGTTTTGTCTTTGGTGGGCAAAAAAACTGGAACTGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCga > 2:6728595/1‑149 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGc > 2:387819‑M2/139‑150 (MQ=255) tCTTTGGTGGGCAAAAAAACTGGAACTGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaaggga < 1:2998490‑M2/150‑8 (MQ=255) tggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGa < 1:140818‑M2/24‑1 (MQ=255) 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ctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACt > 2:6482589‑M2/108‑150 (MQ=255) tGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtc > 1:464139‑M2/1‑117 (MQ=255) atcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTAc > 1:7334438‑M2/105‑150 (MQ=255) ggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCAt < 1:6427672‑M2/49‑1 (MQ=255) aaTCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctg < 1:5082964‑M2/150‑40 (MQ=255) 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ccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCAcc > 2:21207‑M2/35‑150 (MQ=255) accttgtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCt > 1:4355203‑M2/33‑150 (MQ=255) aTGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaatggatcaataatccccacattccaaccgtccacatgattccctatgctgtgctcccgatttcattatggagccagcccgccatcatgagccccgacagaaaagt < 2:846934‑M2/150‑108 (MQ=255) tGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtc < 1:1831509‑M2/150‑109 (MQ=255) tGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtc < 1:3251705‑M2/150‑109 (MQ=255) gtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCa < 1:6962684‑M2/123‑1 (MQ=255) gtggtaggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCa > 1:6057897‑M2/28‑150 (MQ=255) taggtggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCtt < 2:228525‑M2/127‑1 (MQ=255) gCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagt > 1:7890899‑M2/1‑34 (MQ=255) tggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATc > 2:7439609‑M2/20‑120 (MQ=255) tggggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACt > 1:5714567‑M2/20‑150 (MQ=255) cATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctac > 2:7753437‑M2/1‑30 (MQ=255) cATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctac > 1:7569017‑M2/1‑30 (MQ=255) ggttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCa < 1:4773394‑M2/134‑1 (MQ=255) ttcatggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGc < 1:7447579‑M2/136‑1 (MQ=255) ccTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttcttt > 2:3389655‑M2/1‑22 (MQ=255) ccTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttcttt < 1:3389655‑M2/90‑69 (MQ=255) atggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGc > 2:1004547‑M2/12‑150 (MQ=255) atggatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGc > 2:3144084‑M2/12‑150 (MQ=255) cTGACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccct < 1:1319924‑M2/150‑130 (MQ=255) gatcggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACAATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGAAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAAc > 2:5447770‑M2/9‑150 (MQ=255) gACGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaa < 2:1987362‑M2/150‑132 (MQ=255) aCGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaag > 2:4042155‑M2/1‑18 (MQ=255) cGAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagc > 2:7137799‑M2/1‑17 (MQ=255) gAATGACAGCGTAATGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcc < 1:4489007‑M2/150‑135 (MQ=255) ggttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTg < 2:1202058‑M2/146‑1 (MQ=255) ttACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGc > 1:2147430‑M2/3‑150 (MQ=255) | TGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTGGTGGGCAAAAAAACTGGAACTGCTCGAATCACTGCGGGAGCGGAGATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAATCATGAAATGTGCGTCATTTATACCTGACGAATGACAGCGTAATGCTACGCTCGCGGAAATACTCAGCACGGATACTTACCATGGAAATGAACTGGCATCAGGCCCTGCAAGAGAGCCTAAGCTGGCTGGCAATCGCCTCGTTCATCACCCTTGTCAGCTTCACTGCAGCCGCAACTCTGGCCG > NC_002947/2555861‑2556159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |