New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1762884 = | 14 (0.840) | 3 (0.190) | 3/276 | 1.8 | 20.3% | coding (476/477 nt) | PP_1569 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1762915 = | 10 (0.620) | coding (31/342 nt) | PP_1570 | head‑tail adaptor |
ATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCGGTGAGCCTGAATGGGTCACTCGCTGGGAGAAATGCCCAGCCAGTGTCGAAGACCTGTC > NC_002947/1762740‑1763021 | aTCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCa < 1:253451/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCAt < 2:124526/150‑1 (MQ=255) aagtccctggccgacaggtcttcgacactggctgggcatttctcccagcgagtgacccattcaggctcaccgaactccagtgtcaccgggtcacgcaccggcctcaactcctggatgtcGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATc > 2:67424‑M1/120‑150 (MQ=255) gggCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAg < 1:153338/150‑1 (MQ=255) aCTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGtt < 1:283286/150‑1 (MQ=255) gaggTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGc > 2:76000/1‑94 (MQ=255) gaggTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGc < 1:76000/94‑1 (MQ=255) gaggTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCgg > 1:301452/1‑150 (MQ=255) ccGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGTCACTGGa < 2:322216/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGa < 2:128438/150‑1 (MQ=255) tCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCg < 1:292593/150‑1 (MQ=255) acccattcaggctcaccgaactccagtgtcaccgggtcacgcaccggcctcaactcctggatgtcGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCAt > 2:120914‑M1/66‑95 (MQ=255) acccattcaggctcaccgaactccagtgtcaccgggtcacgcaccggcctcaactcctggatgtcGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCAt < 1:120914‑M1/30‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCGGTGAGCCTGAATGGGTCa > 2:49043/1‑150 (MQ=255) gTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCGGTGAGCCTGAATGGGTCACTCGCTgg < 2:158480/150‑1 (MQ=255) cAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCGGTGAGCCTGAATGGGTCACTCGCTGGgaga < 1:66860/150‑1 (MQ=255) ggATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCGGTGAGCCTGAATGGGTCACTCGCTGGGAGAAATGCCCAGCCAGTGTCGAAGACCTGTc > 2:370638/1‑150 (MQ=255) | ATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGGGTGTGTGATGCAGGCCGGCAGGCTGCGGCACCGCATCGACATCCAGGAGTTGAGGCCGGTGCGTGACCCGGTGACACTGGAGTTCGGTGAGCCTGAATGGGTCACTCGCTGGGAGAAATGCCCAGCCAGTGTCGAAGACCTGTC > NC_002947/1762740‑1763021 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |