| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4647267 = | 18 (1.080) | 4 (0.240) | 4/280 | 1.6 | 19.7% | coding (420/483 nt) | PP_5658 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4647285 = | 15 (0.920) | coding (438/483 nt) | PP_5658 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTAGTCCGCCATGGCCCGCACAACGCCCATCGAGCTGTACC > NC_002947/4647140‑4647434 | cccAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTg > 2:216666/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGTACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTg < 1:286701/150‑1 (MQ=255) gtgggtggacggattccaccaagttagcagaccggtggaatcctgccctgccaccgggccgtcagtcggtctgggcttgcagcatccactggccatccacttcacgggccaggccgctggccggcCCGTGa > 2:257440‑M2/126‑131 (MQ=255) gtgggtggacggattccaccaagttagcagaccggtggaatcctgccctgccaccgggccgtcagtcggtctgggcttgcagcatccactggccatccacttcacgggccaggccgctggccggcCCGTGa < 1:257440‑M2/6‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGa < 2:282276/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCgca > 2:250168/1‑114 (MQ=255) cAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCgca < 1:250168/116‑3 (MQ=255) gcgcTGGACCTGACCATCCTCCAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGGCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGCTGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTggcagggca < 1:314182/150‑1 (MQ=255) cgcTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTggcagggcag < 2:243312/150‑1 (MQ=255) ccctgccaccgggccgtcagtcggtctgggcttgcagcatccactggccatccacttcacgggccggccagcggcctggcCCGTGAAGt > 1:250555‑M2/81‑89 (MQ=255) ccctgccaccgggccgtcagtcggtctgggcttgcagcatccactggccatccacttcacgggccggccagcggcctggcCCGTGAAGt < 2:250555‑M2/9‑1 (MQ=255) aTCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCt < 1:202973/150‑1 (MQ=255) ttCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTtggtg < 1:340259/150‑1 (MQ=255) ttCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTtggtg > 1:352697/1‑150 (MQ=255) ttCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTtggtg < 1:384595/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGt < 1:146896/150‑1 (MQ=255) cgccCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTcca < 2:89483/150‑1 (MQ=255) cTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTccaccca > 1:99566/1‑150 (MQ=255) acGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTa < 2:352697/150‑1 (MQ=255) acttcacggGCCAGGCCGCTGGCCGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTggcaggg < 2:250555‑M1/80‑1 (MQ=255) acttcacggGCCAGGCCGCTGGCCGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTggcaggg > 1:250555‑M1/10‑89 (MQ=255) tcacggGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTccacccac > 2:257440‑M1/7‑131 (MQ=255) tcacggGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTccacccac < 1:257440‑M1/125‑1 (MQ=255) ccGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTa < 1:51734/112‑1 (MQ=255) ccGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTa > 2:51734/1‑112 (MQ=255) ccGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTAGTCCGCCATGGCCCGCACAACGCCCATCGAGCTGTAcc < 1:216666/150‑1 (MQ=255) | CCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTAGTCCGCCATGGCCCGCACAACGCCCATCGAGCTGTACC > NC_002947/4647140‑4647434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |