| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 209888 = | NA (NA) | 10 (0.040) | 4/272 | NT | 100% | coding (15394/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 209911 = | 0 (0.000) | coding (15417/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein | |||||
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGcg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/210036‑209888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC > NC_002947/209911‑210061 TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:8828157/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC > 1:2711423/1‑150TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 1:6282392/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:8682809/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:7410525/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:1530725/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:1951088/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:4698317/150‑1TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGC < 2:2791258/150‑1 CGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCG > 2:2062642/1‑150 GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCG < 2:8741327/85‑1 GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCG > 1:8741327/1‑85 TCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCAC > 1:3425724/1‑150 TCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCAC > 1:453445/1‑150 TCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGG > 1:1338757/1‑67 TCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGG < 2:1338757/67‑1 TCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCAC > 2:8945789/1‑150 GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGA > 1:4717093/1‑150 TCGGTCACCGACGTGCTGACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGAC > 2:7266302/1‑150 TCGGTCACCGACGTGCTGACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGAC > 2:7266321/1‑150 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC < 2:3439332/150‑1 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC < 2:4331938/150‑1 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC < 2:2108690/150‑1 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC < 2:6469194/150‑1 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC > 2:784835/1‑150 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC > 2:7882671/1‑150 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC > 2:7883673/1‑150 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC > 1:7084881/1‑150 GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC < 1:1297147/150‑1 TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGcg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/210036‑209888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAAC > NC_002947/209911‑210061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |