New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 209888 = | NA (NA) | 10 (0.040) | 4/272 | NT | 100% | coding (15394/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 209911 = | 0 (0.000) | coding (15417/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
GGCACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGCGCTAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAGGGCGCGGATGTCGGCAAGTTCGAACAGCTTACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGAC > NC_002947/209762‑210037 | tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc > 1:2711423‑M2/150‑150 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:8828157‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:8682809‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:7410525‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 1:6282392‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:4698317‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:2791258‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:1530725‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggc < 2:1951088‑M2/1‑1 (MQ=255) cgtgggccagcggctggttgacgtgcacggtgaaggtcggcttgacgttctcggccaccgaggtctggtcggcggtgatggtgaccttgaccaagtcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCg > 2:2062642‑M2/149‑150 (MQ=255) ggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCAcggccg > 1:8741327‑M2/30‑85 (MQ=255) ggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCAcggccg < 2:8741327‑M2/56‑1 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAgg > 1:1338757‑M2/27‑67 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAgg < 2:1338757‑M2/41‑1 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCAc > 1:453445‑M2/27‑150 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCAc > 1:3425724‑M2/27‑150 (MQ=255) tcgtcggtaaccgacgtgctgaccggCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCAc > 2:8945789‑M2/27‑150 (MQ=255) gtcggtcaccgacgtgctgaccgaCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGa > 1:4717093‑M2/25‑150 (MQ=255) tcggtcaccgacgtgctgaccgaCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGAc > 2:7266302‑M2/24‑150 (MQ=255) tcggtcaccgacgtgctgaccgaCGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGAc > 2:7266321‑M2/24‑150 (MQ=255) | GGCACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGCGCTAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAGGGCGCGGATGTCGGCAAGTTCGAACAGCTTACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGAC > NC_002947/209762‑210037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |