| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5636579 = | 342 (1.240) | 18 (0.070) | 8/258 | NT | 5.7% | intergenic (+182/+201) | putA/PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | 5636645 = | 277 (1.080) | intergenic (+248/+135) | putA/PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein | |||||
TCCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5636736‑5636579‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acccgcgaaGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAACCATTGGTG > NC_002947/5636645‑5636793 TCCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTA > 1:8402782/1‑150TCCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTA > 2:1154918/1‑150 CCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTCCACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTAC < 2:5377986/150‑1 CCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTAC < 2:2585056/150‑1 CCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTAC > 1:6198415/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 2:3938552/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 2:3862200/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 2:3247052/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 2:2661695/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 1:1634861/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 2:2543753/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 1:1218437/1‑150 CCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACC > 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1:5801454/1‑150 AGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCTCTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAACCATTGGTG < 1:5787326/150‑1 AGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAACCATTGGTG < 2:4222726/150‑1 TCCCCGATCCAACCCGCGCTTCCACTTGCCTTAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTAGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCATGTGTATAGGGGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5636736‑5636579‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acccgcgaaGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAACCATTGGTG > NC_002947/5636645‑5636793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |