| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5636579 = | 342 (1.240) | 18 (0.070) | 8/258 | NT | 5.7% | intergenic (+182/+201) | putA/PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | 5636645 = | 277 (1.080) | intergenic (+248/+135) | putA/PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein | |||||
Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
GTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAACCATTGGTGA > NC_002947/5636497‑5636794 | ggTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg > 2:14838/1‑150 (MQ=255) tCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGcc > 1:5321494/1‑150 (MQ=255) gCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAc > 1:7960900/1‑150 (MQ=255) cGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACctgct < 1:3715989/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAAt > 2:2732580/1‑150 (MQ=255) gggTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAAttt < 2:6097986/150‑1 (MQ=255) gtgtCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCt > 2:3085383/1‑150 (MQ=255) tgtCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTa < 2:7901496/150‑1 (MQ=255) tcttctGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTAcc > 1:7504034/1‑150 (MQ=255) tcttctGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTAcc > 1:5200327/1‑150 (MQ=255) cttctGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTAccc < 1:2468593/150‑1 (MQ=255) ttctGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACccg > 2:6857563/1‑150 (MQ=255) ttctGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACccg > 2:5685296/1‑150 (MQ=255) ttctGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACccg > 2:355103/1‑150 (MQ=255) tttttACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCTGTCCTTTCGCGGTTAAACCCGCCAATATACACATGAACACGCCGTCGTGTAGGAGAGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGtt < 1:4434085/147‑1 (MQ=37) ttgttACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGtt > 1:8944295/1‑150 (MQ=255) gttACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCGATACACATGCACAGGCCGTCGTGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCa > 1:6314885/1‑150 (MQ=255) ttACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCAc > 2:4292797/1‑150 (MQ=255) 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tataCACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCt > 2:2092658/1‑150 (MQ=255) tataCACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCt < 2:57084/150‑1 (MQ=255) acacATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTccc < 1:540092/150‑1 (MQ=255) acaTGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCt > 2:3355309/1‑150 (MQ=255) acaTGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCt > 2:6407912/1‑150 (MQ=255) aTGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTca < 2:7467316/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTcagacaga < 1:6214284/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGc > 1:1117274/1‑150 (MQ=255) ccGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCt > 2:8286369/1‑150 (MQ=255) cgtcgtGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTc > 2:5920034/1‑150 (MQ=255) tcgtGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGa < 1:5632669/128‑1 (MQ=255) gtgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGc < 2:5321494/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAg < 1:854654/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAg > 1:2296367/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAg > 2:5200151/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTATGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGtt > 2:3438663/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTc > 1:3463056/1‑150 (MQ=255) cACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCaaa < 2:8110372/150‑1 (MQ=255) acccgcgaaGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAAc < 1:7878324‑M2/141‑1 (MQ=255) cccgcgaaGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAAcc > 1:6791190‑M2/9‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gagGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTg < 2:2969302/70‑1 (MQ=255) | GTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTATACACATGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATTTCTACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTAAGGCAAGTGGAAGCGCGGGTTGGATCGGGGACTATCCGGAGCTCCCCTCAGACAGAGCTCCGGCCAAAAGTTGCTCAAACCATTGGTGA > NC_002947/5636497‑5636794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |