| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 507040 | 255 (0.930) | 24 (0.100) | 13/250 | NT | 8.8% | intergenic (+49/+84) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
| ? | NC_002947 | = 507074 | 269 (1.080) | intergenic (+83/+50) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP | |||||
Only 100 of 398 total aligned reads displayed.
TTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTT > NC_002947/506891‑507189 | ttGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 2:5589537‑M1/1‑150 (MQ=255) cGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAgg < 2:7711896/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGtt < 1:3600306/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTgc < 2:7615487/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTgc < 2:4240540/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTgcg < 2:2418230/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCa > 2:5157465/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGc < 1:7617851/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGcc > 1:2877267/1‑150 (MQ=255) gcTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAg < 1:178165/150‑1 (MQ=255) gcTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAg < 1:4263006/150‑1 (MQ=255) gcTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAg < 1:8458569/150‑1 (MQ=255) tGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgagg > 2:572759‑M1/1‑129 (MQ=255) tGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTTGCGCAAGCCTCAGGc < 2:6708980/150‑1 (MQ=255) tGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGc > 2:6556512/1‑150 (MQ=255) tGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGc > 2:3316372/1‑150 (MQ=255) tGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGc > 2:2891727/1‑150 (MQ=255) gggAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGAGTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACTAGGTTGCGCAAGGCTCAGGCATACGa > 2:7831411/1‑150 (MQ=255) ggAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAg > 1:1182265/1‑150 (MQ=255) gaagaaACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAgg < 1:488741/150‑1 (MQ=255) gaagaaACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAgg < 2:7999393/150‑1 (MQ=255) agaaACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGcc < 2:5982181/150‑1 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgta > 1:8060916‑M2/1‑147 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgta > 1:3350001‑M2/1‑147 (MQ=255) ctcAACCAGCGCCGGGCGATGGTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtag > 2:8779319‑M2/2‑146 (MQ=255) aTCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtag < 2:868762‑M2/150‑5 (MQ=255) aTCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtag < 2:856629‑M2/150‑5 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagc < 1:2109152‑M2/150‑9 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagc < 2:8568642‑M2/150‑9 (MQ=255) caaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcg < 2:4151913‑M1/150‑44 (MQ=255) caaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcg < 1:5637234‑M2/150‑10 (MQ=255) caaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGGCgtaggagcg < 1:82612‑M2/150‑10 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgg < 1:7099483‑M1/150‑45 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgg < 1:7959920‑M1/150‑45 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg < 2:3460677‑M2/150‑11 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg < 1:3430203‑M2/150‑11 (MQ=255) ggCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc > 1:904224/1‑150 (MQ=255) cGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:2301295/150‑1 (MQ=255) 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gCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgt < 1:8815221‑M2/150‑109 (MQ=255) gCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTgc < 1:6304139/150‑1 (MQ=255) ccTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGcc < 2:44603/150‑1 (MQ=255) cTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCa > 1:5288596/1‑150 (MQ=255) tACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttgatg > 1:6137445‑M1/1‑3 (MQ=255) tACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttgatg < 1:6739942‑M1/150‑148 (MQ=255) tACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttgatg < 2:4887518‑M1/150‑148 (MQ=255) tACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAg > 2:7492380/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAg > 1:3314245/1‑150 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGtt < 1:5117911/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGtt < 2:2772836/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGCCCGTCGAAGGCGCGGGTGCACCCGCGAATCGGCCGCAAAGCGCCCCCCAGCAATACAGAAGTCCACGCAAACCCCCACGCTAATACCCTGATGCGTCAACGCATCACTCAAGCGCCAGtt > 2:8320000/1‑150 (MQ=255) | TTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTT > NC_002947/506891‑507189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |