| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 507040 | 255 (0.930) | 24 (0.100) | 13/250 | NT | 8.8% | intergenic (+49/+84) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
| ? | NC_002947 | = 507074 | 269 (1.080) | intergenic (+83/+50) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP | |||||
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
AACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGT > NC_002947/506925‑507223 | aaCCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCcgtc < 2:8766040/150‑1 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgta > 1:3350001‑M2/1‑147 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagc < 1:5558105‑M2/150‑9 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagc < 2:8568642‑M2/150‑9 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagc > 2:7807475‑M2/1‑142 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagc > 2:7588768‑M2/1‑142 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg > 1:1081798‑M2/1‑140 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg < 2:1717138‑M2/150‑11 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg < 1:4856473‑M2/150‑11 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg > 2:8398745‑M2/1‑140 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg < 1:3430203‑M2/150‑11 (MQ=255) ccGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCa < 1:5686136/150‑1 (MQ=255) ggCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc > 1:904224/1‑150 (MQ=255) 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tGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAg > 1:1463852/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCATGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCgg > 2:1895587/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCgg > 2:3305338/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGc < 1:856629/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCa < 2:4283677/150‑1 (MQ=255) 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ttCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAAtatatc > 1:1925811/1‑145 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTACACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 2:6490725/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 2:4196876/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 2:9127058/150‑1 (MQ=255) gCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCACCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTc > 2:1808085/1‑150 (MQ=255) 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ggTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTa < 1:8714730/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTa < 1:4988850/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTa < 2:2981039/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAg > 2:3429562/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAg > 2:2396929/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGt > 2:5669655/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGt < 1:523184/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGt > 2:8446191/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTc < 1:9162906/150‑1 (MQ=255) gcAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTccc > 1:8854941/1‑150 (MQ=255) gCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCACTTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCgcgc > 2:7953356/1‑150 (MQ=255) tCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCaaa > 2:454205/1‑150 (MQ=255) tCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCaaa > 1:7131346/1‑150 (MQ=255) aGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATg > 1:6399333/1‑150 (MQ=255) ggCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGc > 1:3114000/1‑150 (MQ=255) tACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCAccc > 1:401052/1‑150 (MQ=255) cgtcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCt > 1:5938816/1‑68 (MQ=255) cgtcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGccacc > 1:6095613/1‑150 (MQ=255) gtcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGccacca < 2:2877237/150‑1 (MQ=255) gtcatAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGccacca > 2:727391/1‑150 (MQ=255) tcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAg < 1:1717178/150‑1 (MQ=255) tcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAg > 1:1686590/1‑150 (MQ=255) | AACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGT > NC_002947/506925‑507223 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |