| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2075427 | 177 (0.640) | 9 (0.040) | 4/246 | NT | 5.1% | intergenic (‑55/+146) | PP_1847/PP_1849 | TonB‑dependent ferric siderophore receptor/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2075477 | 180 (0.730) | intergenic (‑105/+96) | PP_1847/PP_1849 | TonB‑dependent ferric siderophore receptor/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GCATCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAG > NC_002947/2075279‑2075576 | tCACGCTGTCTTCGGCACGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTc < 2:3832876/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCTGGCTGAGCAGGCTCTGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTc < 1:3827174/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTc > 2:2568631/1‑150 (MQ=255) tCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTc < 2:8574786/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTc < 2:8027337/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTc < 2:6552108/150‑1 (MQ=255) aCGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCt > 2:1341056/1‑150 (MQ=255) cTTCGGAAATCACTGAGGGGCACTGATGGGCCAGGCCCTGGCTGAGGAGTATCAGGGGCTGGCGGGGGTTTTGGGGGGGCTTGGGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCgg < 1:8132677/150‑1 (MQ=255) tgcGGCAAGCACAGAGGGGCACGGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCggg < 1:2681724/148‑1 (MQ=255) tCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGggt > 1:5739232/1‑150 (MQ=255) ggCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCTGGGGCTGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGggtgg < 1:4294210/150‑1 (MQ=255) gCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGggtggt < 1:5466333/150‑1 (MQ=255) cAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGgtggtg < 2:6209265/150‑1 (MQ=255) aGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGAt < 2:3074266/150‑1 (MQ=255) agagGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCAc < 2:2854002/126‑1 (MQ=255) agGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACAcccg > 2:1610877/1‑148 (MQ=255) ggggCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGa < 1:6616376/150‑1 (MQ=255) gggCACTGCAGGGCCTGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGAt < 2:3425191/150‑1 (MQ=255) 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gCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCt < 1:2598686/150‑1 (MQ=255) aggcccaggcTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTa < 1:300818/150‑1 (MQ=255) aggcccaggcTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTa < 1:4416734/150‑1 (MQ=255) ccaggcTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAg > 2:3559284/1‑150 (MQ=255) ggcTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgg < 1:5613845‑M1/150‑53 (MQ=255) ggCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCCACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgg > 2:7239868‑M2/1‑148 (MQ=255) gcTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtggg < 1:7771791‑M1/150‑54 (MQ=255) gcTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtggg < 1:7463955‑M1/150‑54 (MQ=255) tGATCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtt > 2:366763‑M2/1‑145 (MQ=255) tGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtt < 1:694653‑M2/150‑6 (MQ=255) aGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggttta > 1:9055650‑M2/1‑143 (MQ=255) aGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGAGGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggttta > 1:8941362‑M2/1‑143 (MQ=255) gCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttac < 2:4344600‑M2/150‑9 (MQ=255) gCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttac > 2:5877910‑M2/1‑142 (MQ=255) gCTCTGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgc > 1:4871513‑M2/1‑138 (MQ=255) tCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcga < 2:4703766‑M2/150‑15 (MQ=255) tCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACACCTACCCCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCGGTAGGAGCgggtttacccgcga < 2:3248547‑M2/150‑15 (MQ=255) cAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaa > 1:1478672‑M2/1‑135 (MQ=255) ggggCAGGGGGGGGGGATGGGGGGGCACGGGGTGGGGCTCCTGTATGCGAGATACCGGTACTGGCCCTTTGGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGTTGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:8780242/150‑1 (MQ=255) ggggCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATAAACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAaga > 1:2378593/1‑150 (MQ=255) 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cgGGTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcc > 2:4670450‑M1/1‑11 (MQ=255) gggTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcct > 1:6651132‑M1/1‑10 (MQ=255) gggTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcct < 1:6790194‑M1/150‑141 (MQ=255) gggTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcct < 2:5845686‑M1/150‑141 (MQ=255) gggTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcaaccccgcctgcccctgagcct > 2:3172427‑M1/1‑10 (MQ=255) gggTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGTTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTa < 1:3981277/150‑1 (MQ=255) ggTAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcctg > 2:4994612‑M1/1‑9 (MQ=255) tAAACCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcctgct < 2:1675219‑M1/150‑144 (MQ=255) aaCCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcctgctca < 1:694637‑M1/150‑146 (MQ=255) aaCCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATtcag > 1:1721607/1‑150 (MQ=255) aCCCgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgc < 2:7049746‑M1/130‑127 (MQ=255) aCCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATtcagt > 2:6046395/1‑150 (MQ=255) ccgctcctacagggtgatcaccatctgttgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcaggctcaggg < 2:89557‑M1/150‑149 (MQ=255) ccgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcctgctcagcc > 1:2813892‑M1/1‑2 (MQ=255) ccgctcctacagggggatcaccatctggtgtatcaccacccggtgtaggagtgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcctgctcagcc > 1:1965820‑M1/1‑2 (MQ=255) ccACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaagaggccggcacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgccccagagcctgctcagcc < 1:7919772‑M2/150‑99 (MQ=255) ccACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATtcagtca < 2:694653/150‑1 (MQ=255) ccACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATtcagtca < 1:2568631/150‑1 (MQ=255) cACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCGGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaaagggccagtacaggtatcgcgcatccaggagccccaccgcatgcccccgcatcacccccgcctgcccctgagcctgctcagcct < 1:8240069‑M2/150‑100 (MQ=255) cACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATtcagtcag > 1:7684247/1‑150 (MQ=255) | GCATCACGCTGTCTTCGGCAAGCACAGAGGGGCACTGCAGGGCCAGGCCCAGGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAG > NC_002947/2075279‑2075576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |