| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2075427 | 177 (0.640) | 9 (0.040) | 4/246 | NT | 5.1% | intergenic (‑55/+146) | PP_1847/PP_1849 | TonB‑dependent ferric siderophore receptor/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2075477 | 180 (0.730) | intergenic (‑105/+96) | PP_1847/PP_1849 | TonB‑dependent ferric siderophore receptor/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
GGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGATCTTCGA > NC_002947/2075330‑2075626 | ggCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:2813892‑M2/1‑148 (MQ=255)ccctgAGCCTGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACAACAGATGGTGATCACCCTGTAGGAGCgg < 2:89557‑M2/148‑3 (MQ=255) gCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCggg > 1:523381‑M2/1‑147 (MQ=255) tGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtt < 1:694653‑M2/150‑6 (MQ=255) tgctggCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTa < 1:8942316/146‑1 (MQ=255) aGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGAGGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggttta > 1:917742‑M2/1‑143 (MQ=255) gCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttac > 2:5877910‑M2/1‑142 (MQ=255) aGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttaccc > 1:6650957‑M2/1‑140 (MQ=255) gCTCTGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgc > 1:4871513‑M2/1‑138 (MQ=255) tCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcga < 2:3942017‑M2/150‑15 (MQ=255) tCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcga > 1:7527326‑M2/1‑136 (MQ=255) tCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACACCTACCCCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCGGTAGGAGCgggtttacccgcga < 2:3248547‑M2/150‑15 (MQ=255) cAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaa > 2:7215356‑M2/1‑135 (MQ=255) cAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaa > 1:1478672‑M2/1‑135 (MQ=255) cAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaa > 1:6412321‑M2/1‑135 (MQ=255) cAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCgggtttacccgcgaa > 1:5306641‑M2/1‑135 (MQ=255) aGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 2:4251414/1‑150 (MQ=255) aGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 2:3010762/1‑150 (MQ=255) ggggCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATAAACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAaga > 1:2378593/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 2:7933588/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 2:6049841/150‑1 (MQ=255) ggTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGGGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg < 2:3812403/150‑1 (MQ=255) gTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGc < 1:3504853/150‑1 (MQ=255) gggCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGaaaaa < 1:4400787/150‑1 (MQ=255) cttGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAggc < 2:4973395/148‑1 (MQ=255) aTGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAggcg > 2:6476977/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAggcgg < 2:2097805/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCAACACCCGGTGGTGATACACCCCATGGTGATCCCCCAGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACACGCCAAGAAAAAggcgg > 1:3961982/1‑150 (MQ=255) gTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATc > 2:2209802/1‑150 (MQ=255) gTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATc < 1:1396297/150‑1 (MQ=255) gggCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTa < 2:8182831/150‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTAc < 1:309830/150‑1 (MQ=255) tCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCAGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAATGCGGCAACTTAACAg > 1:7992844/1‑150 (MQ=39) ccTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAgc > 1:6853986/1‑150 (MQ=255) gATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAgccgcc < 1:2918530/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAgccgcc > 1:3726899/1‑150 (MQ=255) aTGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCt > 1:3654329/1‑150 (MQ=255) gcgcGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTc < 2:7167057/150‑1 (MQ=255) cgcgATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTcc < 1:696653/150‑1 (MQ=255) gcgATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCca > 2:8694280/1‑150 (MQ=255) gcgATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCGGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCca > 1:1976868/1‑150 (MQ=255) gATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGATAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCcaca < 2:737638/150‑1 (MQ=255) gATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCcaca < 1:1962236/150‑1 (MQ=255) 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gTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCa < 1:8720477/150‑1 (MQ=255) cacccggtGTAGGAGTGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAATAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGtt > 1:374362/8‑150 (MQ=255) aTCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGtt < 1:3249041/150‑1 (MQ=255) ccggtGTAGGAGTGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTc < 2:7100421/146‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCAt < 1:4402498/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCAt > 2:4678989/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCAt < 1:1675219/150‑1 (MQ=255) tcttcgCGGGTAAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGAt > 1:2939535/6‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGGGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGATCtt > 2:6555597/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGATCTTCg > 2:1269964/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGATCTTCGa > 1:387202/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGATCTTCGa > 1:1116157/1‑150 (MQ=255) | GGCTGAGCAGGCTCAGGGGCAGGCGGGGGTGATGCGGGGGCATGCGGTGGGGCTCCTGGATGCGCGATACCTGTACTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACCGGGTGGTGATACACCAGATGGTGATCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGAAAAAGGCGGCATCTTACCAGCCGCCTTCCACATAAAACGATCCAGGCCCGGTGTATTCAGTCAGCCTTTCCTGATCGGCCGCTTGTGCTGCCGCCAGTTGTCATCGATCTTCGA > NC_002947/2075330‑2075626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |