| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2080205 = | 191 (0.690) | 15 (0.060) | 11/242 | NT | 9.2% | intergenic (+25/+90) | PP_1853/PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2080286 = | 130 (0.540) | intergenic (+106/+9) | PP_1853/PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAACC > NC_002947/2080141‑2080434 | tGGGGGGGCGGTTCGTTGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTTTTGCCTGTGCCGGCCTTTGCGCGGGCCCGCCCGAACCCACTGGTATATCACACCCCTTATGACTGTGGGGTCCTTTTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGtt < 2:2498871/150‑1 (MQ=255) gggggggcggTTCGATGCCCTGCTGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGGGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTc < 2:4741559/147‑1 (MQ=255) ggggcggTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGGCCGCCCGCACCCACCGGGATAAAAAAGCCCCGAAAAAAGAGGGGTGCGTGTGGGGGCGGGGGGGCCCGCCGCGAGGCCCGGTCAgc > 1:1672122/1‑149 (MQ=255) 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cAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATAACACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGa < 2:7181279/150‑1 (MQ=255) cTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCtg > 2:3638768/1‑150 (MQ=255) gagaATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTgcgc > 2:8136694/1‑150 (MQ=255) agaATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGCTAACACAGCCCGGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGGGCGGGCGGGCCCGCGACCAGGCCGGGTCCGACCACAAGGCCCAAGAACGGTACCGGTGCGcc > 1:2850125/1‑150 (MQ=255) agaATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGATATCACACCCCAGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGGAGAGGCCCGTTCAGACAACAACGACAAAGAAACATACCAGTGCGcc > 2:3113998/1‑150 (MQ=255) agaATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATAACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGcc > 2:7042889/1‑150 (MQ=255) attattGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGATAACACAGCCCTGATGACTGTGGGGTCCTTGGGGGAGCGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAg < 2:7109256/150‑1 (MQ=255) attattGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGCCCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAg < 2:725343/150‑1 (MQ=255) tattGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGt < 2:2826694/150‑1 (MQ=255) tattGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACACGGATATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCCGGCCCCCGAAGAGGCCCGTTCAGACAACATAGACAAAGAACCATACCTGTGCGCCCAgct > 2:8654965/1‑148 (MQ=255) 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gcccgctcccacaaggaccccactgtcttcagggctgtgatatccctgtgggtgcgggcgggcccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCca > 2:8586212‑M2/71‑147 (MQ=255) ccgctcccacaaggaccccactgtcttcagggctgtgatatccctgtgggtgcgggcgggcccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGt > 2:819267‑M2/69‑150 (MQ=255) ccgctcccacaaggaccccactgtcttcagggctgtgatatccctgtgggtgcgggcgggcccgcgaaAAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGt > 1:936437‑M2/69‑150 (MQ=255) ccccACCGGTATACCACCGCCCTGCCGCCCGGGGGGGCCTGGGGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgct < 1:6929491/149‑1 (MQ=255) aCCCACCGGGATAACACAGCCGTTACGACAGTGGGTTCATTGGGGGAGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgct < 1:5612260/150‑1 (MQ=255) 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ccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCt > 1:7049407‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCt > 2:204216‑M2/8‑150 (MQ=255) cgctaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCtt < 1:3162533‑M2/144‑1 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCCATc > 1:2305422‑M2/6‑147 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATc < 2:2304922‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATc < 2:2305422‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATc > 1:2304922‑M2/6‑147 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTc < 1:6258172‑M2/145‑1 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTc > 1:3540206‑M2/6‑150 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTc > 1:1534026‑M2/6‑150 (MQ=255) cgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAgc > 1:6284243‑M2/5‑98 (MQ=255) cgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAgc < 2:6284241‑M2/94‑1 (MQ=255) gaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCaa > 1:8648001‑M2/4‑150 (MQ=255) gaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCaa < 1:3638768‑M2/147‑1 (MQ=255) aaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAAc < 1:7294004‑M2/148‑1 (MQ=255) aGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCCGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAAcc > 1:8975360‑M2/2‑150 (MQ=255) | GGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAACC > NC_002947/2080141‑2080434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |