New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5562693 = | 280 (1.020) | 17 (0.070) | 12/262 | NT | 6.5% | intergenic (‑224/+78) | hisZ/hflC | ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit/integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
? | NC_002947 | 5562757 = | 223 (0.850) | intergenic (‑288/+14) | hisZ/hflC | ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit/integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
CAAACCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGAAATCAGCGTCCTGGCTG > NC_002947/5562609‑5562906 | cAAACCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCCGGCGGGGTGCCGCTGCCTGAAAATc > 2:8399069/1‑150 (MQ=255) aaaCCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCa < 2:3052109/150‑1 (MQ=255) agagcgacgtgatggtcctggacccgaagaacgaattcttccgttacctggacaagagcagaccgtgatgctcaggccctgaTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAg > 1:9124983‑M1/83‑150 (MQ=255) aagcgcgacgtgatgggccgggacccgaacaacgaattcttccgttacctggacaagagccgaccgtgatgctcaggccatgattttcatgcagcggcaccccgcctggcagctaatgcaccaggcggggtgccgctgcatgaaaaTCAg < 2:2709170‑M2/4‑1 (MQ=255) aaCCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAg > 1:6248894/1‑150 (MQ=255) aCCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAgg < 2:6734354/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGACGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAgg < 1:5911013/150‑1 (MQ=255) gTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGcc > 1:6770532/1‑150 (MQ=255) tCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCt > 1:8839572/1‑150 (MQ=255) tCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCt < 1:865345/150‑1 (MQ=255) tCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCt > 2:2096061/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCTGACGCATAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCTTTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGa < 2:3743383/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCA‑CCCACCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAg > 1:4279638/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCGCTGAGCAAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGa < 1:2935916/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCa > 2:5174146/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCAt < 2:8805325/150‑1 (MQ=255) gcgaTGACCCAATCAACCTTGCAGACCAAAAAAAGCCGGTAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATc < 1:7680840/150‑1 (MQ=255) cgcTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCa < 2:5711263/150‑1 (MQ=255) 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ttGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCa > 1:320303/1‑150 (MQ=255) ttGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGCCTGCTCTTGTCCa > 2:7631271/1‑150 (MQ=255) tGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAg < 2:7074513/150‑1 (MQ=255) tGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAg < 1:6696170/150‑1 (MQ=255) gACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTaa < 2:22944/150‑1 (MQ=255) 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cTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCt < 2:7257401/150‑1 (MQ=255) tGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTg > 2:6538453/1‑150 (MQ=255) ggTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGc > 1:5597043/1‑150 (MQ=255) gTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCa < 1:645037/150‑1 (MQ=255) gTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCa < 1:2333341/150‑1 (MQ=255) gCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAgg < 1:6547737/150‑1 (MQ=255) cATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGc > 2:8010184/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGGCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACgg < 2:4734494/150‑1 (MQ=255) tGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTg > 2:2949144/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTgg > 1:2176378/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGGTGCCGCTGCTTGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAAc < 2:2813857/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAAc < 1:5021909/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAAc < 1:3459487/150‑1 (MQ=255) ggggTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCAt > 1:8252028/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATa < 1:7497063/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGaa < 2:4279638/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATGACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGt > 2:1937022/1‑136 (MQ=255) gCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGAAATCa < 2:5959723/150‑1 (MQ=255) gCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGAAATCa > 2:1671044/1‑150 (MQ=255) cTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGAAATCAg > 2:9115420/1‑150 (MQ=255) tgaaaaTCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGAAATCAGCGTcc > 1:4698322‑M2/7‑150 (MQ=255) | CAAACCGTCAACCGGCGCTGAGCCAATCAACCTTGCAGACGCAAAAAAGCCGGGAAATTTCCCGGCTGCCTCATCATACACCCCTTTTCATTCAGGATGCACCCCGCCTGGTGCATTAGCTGCCAGGCGGGGTGCCGCTGCATGAAAATCAGGGCCTGAGCATCACGGTCTGCTCTTGTCCAGGTAACGGAAGAATTCGTTCTTCGGGTCCAGGACCATCACGTCGCTCTTGCTCGAGAAGCTCTCGCGGTATGCCTGCAGGCTACGGTGGAACGCATAGAAATCAGCGTCCTGGCTG > NC_002947/5562609‑5562906 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |