New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4585460 | 71 (0.470) | 13 (0.100) | 9/236 | NT | 17.5% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | = 4585521 | 62 (0.480) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCA > NC_002947/4585311‑4585608 | ttGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTA < 2:3642631‑M1/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:5007259/150‑1 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 2:2168265/150‑1 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 1:190564/150‑1 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTCGACCACAGCGGGTCGCCGCCGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACACCCGAGCTGGCGCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 2:3122464/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAt < 2:2104313/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCGGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAt < 1:2769294/150‑1 (MQ=255) ggTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccg > 1:2580116‑M1/1‑137 (MQ=255) ggTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGa < 2:4842226/150‑1 (MQ=255) gTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGac < 1:3634457/150‑1 (MQ=255) tGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACcgc > 1:3226034/1‑150 (MQ=255) tGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACcgc < 1:1579186/150‑1 (MQ=255) cGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt < 2:1257912/150‑1 (MQ=255) 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cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCGTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGc > 1:1607646/1‑150 (MQ=255) ccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGcc > 1:4890265/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGa > 1:2632183/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGaa > 1:1780871/1‑150 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaa < 2:2475382‑M1/150‑137 (MQ=255) 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gggTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcc > 2:782605‑M1/1‑7 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAgg > 1:3582863/1‑150 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCACGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAgg > 2:1670977/1‑150 (MQ=255) ggTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttccc < 2:2394970‑M1/150‑145 (MQ=255) gTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTg > 2:2762730/1‑150 (MQ=255) 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TTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCA > NC_002947/4585311‑4585608 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |