| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5161746 | 24 (0.160) | 17 (0.140) | 10/214 | NT | 38.4% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5161761 | 36 (0.310) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCT > NC_002947/5161606‑5161895 | cGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGc < 2:158231/150‑1 (MQ=255) aaTTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCCGGTTCGcgt > 2:4355225/1‑148 (MQ=255) tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt > 2:3320549‑M2/1‑149 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgt > 1:2051979‑M2/1‑147 (MQ=255) agagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgta > 1:1599089‑M2/1‑146 (MQ=255) agagTGGCAGCCACAGGGAGTGGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgta > 2:2602374‑M2/1‑146 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtag < 2:1589738‑M1/150‑21 (MQ=255) tGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggag < 2:4903560‑M1/150‑24 (MQ=255) ggCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagc > 1:4799164‑M2/1‑141 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 1:2970889‑M1/150‑27 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:1028295‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:495825‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTAAGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 2:3206944‑M1/150‑27 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGGTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 2:419286‑M1/150‑27 (MQ=255) gaccacAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGTG‑CCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:2093480‑M2/3‑139 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcggg < 1:1828314‑M1/150‑28 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcggg < 1:3612982‑M1/150‑28 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 2:255645‑M2/1‑138 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:66317‑M2/1‑138 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTGGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcggg < 2:4846495‑M1/150‑28 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACCCCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTggtaggagcgggtt > 2:4514203‑M2/1‑136 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGTGCC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggt < 1:2496370‑M1/150‑29 (MQ=255) cacaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggttt > 2:3625584‑M2/1‑135 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtag < 2:953488‑M1/139‑21 (MQ=255) caGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac > 2:3361508‑M2/1‑133 (MQ=255) gTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttaccc > 1:4595879‑M2/1‑131 (MQ=255) tGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCGCTCGTtgtaggagcgggtttacccg < 2:2037518‑M2/150‑21 (MQ=255) ttGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1988465‑M2/1‑126 (MQ=255) gtgCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtaaacccgctcc > 2:4504178‑M2/2‑126 (MQ=255) gcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGG‑TGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAAGGCCGGc‑ac > 2:1158773/1‑150 (MQ=255) gTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAAACCCCGCCAAAACACGGTCGCTATACT‑TGTAGGAGCGGGGTTTCCCCCGAAAATGGCGGC‑CCACGCCACACAGAtcacga > 1:809767/1‑146 (MQ=255) caccacCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGGAAACCCCCGCCGACACAGGTTCGCGTTGGG‑TGGAGGGGGGGGGTTACCCGCGAAAAGGCCCGC‑ACACGCAACACAGATGTCGCAGTCCcg > 2:1862879/1‑150 (MQ=255) aGACCGGCGTTTTTGCGGGGGTCTATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGTAAAACCCTATCCTACACCGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGTTCGTTTTTACCCGCGAAAAGGACGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 2:419806/150‑1 (MQ=255) aGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 2:2978465/150‑1 (MQ=255) cgggtggTTTTGGGGGGGTCTTTTGACCCCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGAAAACCCGCGCCTACACCGGTCCGCATTGTT‑TGTCGGAGGGGTTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGc < 2:124165/145‑1 (MQ=255) gAGGTTTTGTTGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgt > 2:738052‑M1/1‑62 (MQ=255) gAGGTTTTGTTGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgt < 1:738052‑M1/80‑19 (MQ=255) gAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCGTTTCGCGGGTTAAAACCCTCCAACAAACGTTGGCGGTGCG‑TGTTGGAGCGGGTTTTCACCCCCAAAGGCCCGCAAAAGCCAACA‑AGATAAAACAGTCCCCGCGGGAGGGCCAc > 2:210228/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtagga < 2:1616469‑M1/75‑23 (MQ=255) ggggTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACACAGGTTCGCGATCGG‑TGGAGGAGCGGGTTTACCCCCGGAAAGGCCGGC‑ACCGGCAACCCAGATCTCTCAGGCCCGGCGGTAGGGCCACCTCCCCCccgc > 2:2463785/1‑150 (MQ=37) cTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 2:267778‑M2/62‑12 (MQ=255) cTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:267778‑M2/1‑51 (MQ=255) g‑c‑gGCCTTTGCGGGGGTAAACCCGCCCCACCACTGTTTGGCTATCGT‑GTTCGGAGGGTTTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTg < 1:1158773/150‑1 (MQ=255) c‑gGCCTTTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTAAAacgaaagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcccgtgtcaatcgaccccgacaaaaccgcccgtctggtggtgccacaacccggcaaacagcccatgcagct > 2:4522267‑M1/1‑31 (MQ=255) gggCCTTTGCGGGGTAAAACCGGCTCATACACCGTTTCGCTATGGT‑TGTCGGCGGGTTTTAACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGa < 1:741139/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAACCCCGCTACTACACTGGTTCGCTATGGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCTACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 2:1114407/150‑1 (MQ=38) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaa > 2:1988465‑M1/1‑24 (MQ=255) ggagcgggtTTACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaacaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcac > 2:4504178‑M1/4‑24 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCg > 2:528641/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACAacgagcgcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactca < 2:2037518‑M1/150‑131 (MQ=255) 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cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTAGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcag > 1:1557050/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcacaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggtc > 2:2093480‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg > 2:4450709‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg > 1:495825‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg > 1:1028295‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcag < 2:267778‑M1/62‑52 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcag > 1:267778‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcacctcactgtggctg < 2:419286‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 1:714332‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 1:2970889‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:2262682/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGcagcag > 1:3068891/1‑150 (MQ=255) tCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccac > 1:2297419‑M1/1‑7 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccga > 1:1616469‑M2/1‑22 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccga < 2:1616469‑M2/75‑54 (MQ=255) ccTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaa > 1:4958028/1‑150 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc < 2:2033309‑M2/150‑131 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgt > 1:953488‑M2/1‑20 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa > 1:4747437/1‑150 (MQ=255) tACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagccactccctgtggctgccactct > 2:2602374‑M1/1‑4 (MQ=255) tACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactct > 1:1599089‑M1/1‑4 (MQ=255) tACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAt > 2:518122/1‑150 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccaacaaaacctc < 1:738052‑M2/80‑63 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccaacaaaacctc > 2:738052‑M2/1‑18 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc > 1:2051979‑M1/1‑3 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc > 1:3894257‑M1/1‑3 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtca > 2:2940724/1‑149 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 1:4713607/127‑1 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 1:4713673/127‑1 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc > 2:4713673/1‑127 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc > 2:4713607/1‑127 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcct > 2:353631/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcct > 2:353622/1‑150 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcga > 2:3320549‑M1/1‑1 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcga > 2:3503457‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑C‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCT > NC_002947/5161606‑5161895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |