| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5161746 | 24 (0.160) | 17 (0.140) | 10/214 | NT | 38.4% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5161761 | 36 (0.310) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGC > NC_002947/5161613‑5161909 | tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt > 2:3320549‑M2/1‑149 (MQ=255)tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt > 2:3503457‑M2/1‑149 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgt > 1:3894257‑M2/1‑147 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgt > 1:2051979‑M2/1‑147 (MQ=255) agagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgta > 1:1599089‑M2/1‑146 (MQ=255) agagTGGCAGCCACAGGGAGTGGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgta > 2:2602374‑M2/1‑146 (MQ=255) gTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtagga > 1:2297419‑M2/1‑143 (MQ=255) ggCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagc > 1:4799164‑M2/1‑141 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:495825‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:1028295‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:4450709‑M2/1‑139 (MQ=255) gaccacAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:2093480‑M2/3‑139 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 2:255645‑M2/1‑138 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:66317‑M2/1‑138 (MQ=255) gCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggt > 1:2795728‑M2/1‑137 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACCCCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTggtaggagcgggtt > 2:4514203‑M2/1‑136 (MQ=255) cacaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggttt > 2:3625584‑M2/1‑135 (MQ=255) caGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac > 2:3361508‑M2/1‑133 (MQ=255) gTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttaccc > 1:4595879‑M2/1‑131 (MQ=255) tGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCGCTCGTtgtaggagcgggtttacccg < 2:2037518‑M2/150‑21 (MQ=255) ttGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1988465‑M2/1‑126 (MQ=255) gtgCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtaaacccgctcc > 2:4504178‑M2/2‑126 (MQ=255) agctgcATGGGCTGTTTGCCGGGTTGTGGCACCACCAGACGGGCGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACGGGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTTTCGTtttaggagcggttttacccgcgaaaaggccg > 2:4522267‑M2/1‑119 (MQ=255) gcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGG‑TGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAAGGCCGGc‑ac > 2:1158773/1‑150 (MQ=255) cTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGTTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCATACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGTTTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAac < 2:3792472/150‑1 (MQ=255) gTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAAACCCCGCCAAAACACGGTCGCTATACT‑TGTAGGAGCGGGGTTTCCCCCGAAAATGGCGGC‑CCACGCCACACAGAtcacga > 1:809767/1‑146 (MQ=255) caccacCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGGAAACCCCCGCCGACACAGGTTCGCGTTGGG‑TGGAGGGGGGGGGTTACCCGCGAAAAGGCCCGC‑ACACGCAACACAGATGTCGCAGTCCcg > 2:1862879/1‑150 (MQ=255) aGACCGGCGTTTTTGCGGGGGTCTATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGTAAAACCCTATCCTACACCGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGTTCGTTTTTACCCGCGAAAAGGACGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 2:419806/150‑1 (MQ=255) aGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 2:2978465/150‑1 (MQ=255) cgggtggTTTTGGGGGGGTCTTTTGACCCCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGAAAACCCGCGCCTACACCGGTCCGCATTGTT‑TGTCGGAGGGGTTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGc < 2:124165/145‑1 (MQ=255) gAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCGTTTCGCGGGTTAAAACCCTCCAACAAACGTTGGCGGTGCG‑TGTTGGAGCGGGTTTTCACCCCCAAAGGCCCGCAAAAGCCAACA‑AGATAAAACAGTCCCCGCGGGAGGGCCAc > 2:210228/1‑150 (MQ=255) ggggTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACACAGGTTCGCGATCGG‑TGGAGGAGCGGGTTTACCCCCGGAAAGGCCGGC‑ACCGGCAACCCAGATCTCTCAGGCCCGGCGGTAGGGCCACCTCCCCCccgc > 2:2463785/1‑150 (MQ=37) cTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 2:267778‑M2/62‑12 (MQ=255) cTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:267778‑M2/1‑51 (MQ=255) gc‑gGCCTTTGCGGGGGTAAACCCGCCCCACCACTGTTTGGCTATCGT‑GTTCGGAGGGTTTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTg < 1:1158773/150‑1 (MQ=255) gggCCTTTGCGGGGTAAAACCGGCTCATACACCGTTTCGCTATGGT‑TGTCGGCGGGTTTTAACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGa < 1:741139/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAACCCCGCTACTACACTGGTTCGCTATGGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCTACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 2:1114407/150‑1 (MQ=38) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCg > 2:528641/1‑150 (MQ=255) gggTAACCCCGCTCCTACACTGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt < 2:352116/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACA‑ACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 2:3455013/1‑150 (MQ=21) ggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTc > 2:4601021/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcacaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtgg < 1:2496370‑M2/150‑123 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTGGACCCCTTCCCGTTCCTgca > 2:4007353/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagccactcactgtggct < 2:4846495‑M2/150‑124 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggct < 1:1828314‑M2/150‑124 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggct < 1:3612982‑M2/150‑124 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTAGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcag > 1:1557050/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcttacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 2:3206944‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcacctcactgtggctg < 2:419286‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 1:714332‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 1:2970889‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:2262682/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCACTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:2262358/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGcagcag > 1:3068891/1‑150 (MQ=255) cTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgcca < 2:4903560‑M2/150‑128 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccga > 1:1616469‑M2/1‑22 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccga < 2:1616469‑M2/75‑54 (MQ=255) ccTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaa > 1:4958028/1‑150 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc < 2:2033309‑M2/150‑131 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc < 2:1589738‑M2/150‑131 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgt < 2:953488‑M2/139‑120 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgt > 1:953488‑M2/1‑20 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa > 1:4747437/1‑150 (MQ=255) tACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAt > 2:2668405/1‑150 (MQ=255) tACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAt > 2:518122/1‑150 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccaacaaaacctc > 2:738052‑M2/1‑18 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccaacaaaacctc < 1:738052‑M2/80‑63 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtca > 2:2940724/1‑149 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 1:4713673/127‑1 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 1:4713607/127‑1 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc > 2:4713607/1‑127 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc > 2:4713673/1‑127 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcct > 2:353631/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcct > 2:353622/1‑150 (MQ=255) ttCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAcc > 2:2103078/1‑150 (MQ=255) ttCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAcc > 2:532054/1‑150 (MQ=255) cTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgccc > 2:3083670/1‑150 (MQ=255) tATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 1:1389892/1‑150 (MQ=255) tATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 1:1389851/1‑150 (MQ=255) aTCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccgc < 1:4601021/150‑1 (MQ=255) tCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACcgcccgcc > 1:4340688/1‑150 (MQ=255) gT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCcgccgc > 1:858479/1‑150 (MQ=255) gT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCcgccgc > 1:2451842/1‑150 (MQ=255) | TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC‑GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGC‑ACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGC > NC_002947/5161613‑5161909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |