| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 5494516 | 139 (0.910) | 7 (0.050) | 5/266 | NT | 5.0% | coding (1470/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 5494536 | 130 (0.890) | coding (1450/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCC > NC_002947/5494367‑5494665 | gATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GG < 1:3021592‑M1/150‑1 (MQ=255)gATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GG < 2:1558966‑M1/150‑1 (MQ=255) tCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGc > 2:3015851/1‑150 (MQ=255) tCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGc < 2:1961074/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCcac > 1:2422600/1‑150 (MQ=255) cAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACAcc > 1:1972605/1‑150 (MQ=255) aGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCg > 1:3789717/1‑150 (MQ=255) aCCATGGTGCGCTTGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGc < 2:258622/150‑1 (MQ=255) aCCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGc < 2:4399570/150‑1 (MQ=255) cATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTg > 1:2355769/1‑150 (MQ=255) cATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTAGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGACCCGGCCTACCTATTTAACGTCCAAGGACTACAGGAGTGTTCCAGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTg > 1:1718489/1‑150 (MQ=255) aTGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTgg > 1:4131292/1‑150 (MQ=255) tGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGt < 2:572652/150‑1 (MQ=255) tGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGt < 1:1509012/150‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGc < 1:90223/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCgg < 1:3403800/150‑1 (MQ=255) cgcATGTCGCCCATGTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGc > 1:1114469‑M2/1‑149 (MQ=255) cgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGc > 2:4137716‑M2/1‑149 (MQ=255) 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cgcACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACg > 1:4176581/1‑150 (MQ=255) cacaACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCa < 2:1362825/150‑1 (MQ=255) acaACCTCCAGGGccacaccgagctggtgcggcctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatg > 1:883205‑M1/1‑13 (MQ=255) acaACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGcctggccttggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgcca < 2:3538975‑M2/150‑119 (MQ=255) aaCCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 2:3914035/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 2:3914051/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa < 1:679258/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa < 2:4708787/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 2:1314767/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 1:1822949/1‑150 (MQ=255) cTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTc > 1:1235015/1‑150 (MQ=255) tCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGccctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcga < 2:4527989‑M2/150‑125 (MQ=255) tCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGccctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcga < 2:3601929‑M2/150‑125 (MQ=255) tCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCa < 1:453025/150‑1 (MQ=255) cA‑GGccgcaccagctcggtgtggccctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcgacat > 2:1720755‑M1/1‑4 (MQ=255) cA‑GGccgcaccagctcggtgtggccctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcgacat > 1:597998‑M1/1‑4 (MQ=255) cA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGcctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaa < 1:1112201‑M2/108‑85 (MQ=255) cA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGcctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaa > 2:1112201‑M2/1‑24 (MQ=255) ggccgcaccagctcggtgtggccctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcgacatgc < 2:5080545‑M1/150‑149 (MQ=255) ggCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGccc > 2:1087959/1‑150 (MQ=255) ggCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGccc > 2:1087996/1‑150 (MQ=255) gccgcaccagctcggtgtggccctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcgacatgcg > 2:4137716‑M1/1‑1 (MQ=255) | GATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCA‑GGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCC > NC_002947/5494367‑5494665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |