New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5494516 | 139 (0.910) | 7 (0.050) | 5/266 | NT | 5.0% | coding (1470/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
? | NC_002947 | = 5494536 | 130 (0.890) | coding (1450/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCACCTGCCTG > NC_002947/5494387‑5494683 | gcgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCgg < 1:3403800/150‑1 (MQ=255) cgcATGTCGCCCATGTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGc > 1:1114469‑M2/1‑149 (MQ=255) cgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGc > 2:4137716‑M2/1‑149 (MQ=255) cgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGc > 1:1864317‑M2/1‑149 (MQ=255) gcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGcc < 2:5080545‑M2/150‑3 (MQ=255) aTGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGcctg > 1:597998‑M2/1‑146 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCtt < 2:1833723/150‑1 (MQ=255) gACCATTTCTGCCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCtt < 2:1327120/150‑1 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTg > 1:715485/1‑150 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTg < 1:2420104/150‑1 (MQ=255) cATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGga < 2:3629114/150‑1 (MQ=255) cATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGG‑CCGCACC‑AGCTCGGTGTGGccctggaggttgt > 1:883205‑M2/1‑137 (MQ=255) tttCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGgaga > 2:1101584/1‑150 (MQ=255) tttCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGgaga < 1:3872108/150‑1 (MQ=255) tttCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGgaga > 1:2735808/1‑150 (MQ=255) tCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATc < 2:1493683/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCgg < 1:1380218/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg < 2:4204685/150‑1 (MQ=255) 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tACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTc < 2:574223/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGc > 1:379428/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGc > 2:2287559/1‑150 (MQ=255) aGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTgg < 1:489442/150‑1 (MQ=255) aGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGG‑CAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTggg < 2:1604689/150‑1 (MQ=255) 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cGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGtt < 2:3148965/134‑1 (MQ=255) cGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATc > 2:787800/1‑150 (MQ=255) gcgcACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCAc > 2:3186635/1‑150 (MQ=255) cgcACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCCGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACg > 2:2838430/1‑150 (MQ=255) acaACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGcctggccttggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgcca < 2:3538975‑M2/150‑119 (MQ=255) aaCCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 2:1314767/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 2:3914019/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 2:3914051/1‑150 (MQ=255) aaCCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa > 1:1822949/1‑150 (MQ=255) ccTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGt < 1:4213272/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTc > 1:1235015/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCa < 1:453025/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCa > 2:4943918/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGcctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaaggtagtcaccttggccgaactgctgccagaaatggtcgaca < 2:4698609‑M2/150‑126 (MQ=255) cAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGcctggaggttgtgcgccgacatcgtgacgggaacacgcctgtagtccttggccgtgacatcggtaggccggggcagacgctgaa > 2:1112201‑M2/1‑24 (MQ=255) cAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATg > 2:1387695/1‑150 (MQ=255) ggCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGccc > 2:1087959/1‑150 (MQ=255) ggCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGccc > 2:1087996/1‑150 (MQ=255) cacCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCg > 1:5067248/1‑150 (MQ=255) acCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCgg < 1:2710425/150‑1 (MQ=255) gAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGc > 1:3670571/1‑150 (MQ=255) gAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGc > 1:1636359/1‑150 (MQ=255) gctcggTGTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGcc > 1:4285724/5‑149 (MQ=255) cT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCAcc > 1:2640455/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCAcctgc > 1:221250/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCAcctgcctg > 2:4147546/1‑150 (MQ=255) | GCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCACCTGCCTG > NC_002947/5494387‑5494683 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |