| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2316776 | 138 (0.910) | 8 (0.050) | 5/274 | NT | 5.2% | coding (314/888 nt) | PP_2036 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase |
| ? | NC_002947 | = 2316836 | 156 (1.030) | coding (254/888 nt) | PP_2036 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGATGGCGTGCACGCCGCCTGCAA > NC_002947/2316688‑2316983 | gATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGt < 1:1848373‑M2/150‑2 (MQ=255) aTCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTc > 2:2541077/1‑150 (MQ=255) tCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCa > 1:472202/1‑150 (MQ=255) tCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCa > 2:2094563/1‑150 (MQ=255) ggAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAgg < 2:2410856/150‑1 (MQ=255) aaTGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTc < 1:1363668/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGga < 1:3776198/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGga < 2:2045174/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGga < 1:1691740/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGgaga < 1:963619/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCt < 2:5105734/150‑1 (MQ=255) cggcgCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGa < 1:3450597/150‑1 (MQ=255) cggcgCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGa < 1:877761/150‑1 (MQ=255) gACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCt > 2:608721/1‑150 (MQ=255) gACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCt < 2:1221777/150‑1 (MQ=255) gACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCt > 1:1255495/1‑150 (MQ=255) gACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCt > 2:2514751/1‑150 (MQ=255) gACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCt > 2:3397784/1‑150 (MQ=255) 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ttGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTAcg > 2:1747089/1‑150 (MQ=255) ttGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTAcg > 2:1650647/1‑150 (MQ=255) ttGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTAcg > 2:1746893/1‑150 (MQ=255) tGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTAcgc < 2:4465068/150‑1 (MQ=255) gTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGccc < 1:4419576/150‑1 (MQ=255) 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cTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGtgct > 1:2078576/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGccc > 1:491550/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCa > 1:765454/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCa < 1:2755861/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAgc > 1:3417067/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAgc > 2:1685745/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAgcg > 1:2428141/1‑150 (MQ=255) cACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGa > 1:3165901/1‑150 (MQ=255) cGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGATg < 2:3121334/150‑1 (MQ=255) gCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGATgg > 2:1343908/1‑150 (MQ=255) 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gcggTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGATGGCGTGCAcgccatcg < 1:2541077/150‑5 (MQ=255) cggTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGATGGCGTGCACGCCGCCTg < 1:3421926/150‑1 (MQ=255) | GATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGGCCTGTGCCAGGCGGGCACGCTGCACGGTGCGGGCGGTGGTCAGGTCGGAGACGCTGACCACGCTGGGTACGCGCCCGGCAATGCGTGCCTGGCTGAAGCGCACCACGGTTTCCCATTCGCTGTCGGACAGGTAAGCCCCTTCGCCGGTGCTGCCCAGCGGCGCGATGGCGTGCACGCCGCCTGCAA > NC_002947/2316688‑2316983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |