| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTACGTGCTTCGCTGGCTGCCGGCGTGCCGTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAGCGCCGT > NC_002947/2527458‑2527762 | atgttcgctctccttacttggcagccatgcgcagcgcaccgtcgaggcggatgacctcaccgttgagcatgctgttctcgatgatgtggcgggccagcgcggcgtattcctGC‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTGCCGTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAg > 1:1160122‑M1/112‑150 (MQ=255)atgttcgctctccttacttggcagccatgcgcagcgcaccgtcgaggcggatgacctcaccgttgagcatgctgttctcgatgatgtggcgggccagcgcggcgtattcctGC‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTGCCGTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAg > 1:1160371‑M1/112‑150 (MQ=255)atgttcgctctccttacttggcagccatgcgcagcgcaccgtcgaggcggatgacctcaccgttgagcatgctgttctcgatgatgtggcgggccagcgcggcgtattcctGC‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTGCCGTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAg > 1:5072191‑M1/112‑150 (MQ=255) 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gTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAAt > 1:3144355/1‑150 (MQ=255) gTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAAt > 2:1505767/1‑150 (MQ=255) ttCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATg > 2:4068267/1‑150 (MQ=255) ccgccccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGAcc > 1:4105243/1‑150 (MQ=255) ccgccccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGAcc > 1:2115600/1‑150 (MQ=255) gccccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGAcccc > 1:1702978/1‑150 (MQ=255) cccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCAt > 1:4385559/1‑150 (MQ=255) ccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATc < 2:1404500/150‑1 (MQ=255) ccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATc < 2:3352713/150‑1 (MQ=255) ccgcTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGACACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATc < 2:583463/150‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGtt < 2:1551127/150‑1 (MQ=255) cgcccgcAGGACTACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCCTCGTTATCGTCa < 2:4057587/150‑1 (MQ=255) ccgcAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAgcg > 1:2279639/1‑150 (MQ=255) gcAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGACCATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAGCGcc > 2:3991912‑M2/3‑150 (MQ=255) gcAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCAACCGCCTCGACTGTGCGCTGCGCATGTCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAGCGcc > 2:1601684‑M2/3‑150 (MQ=255) aGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAGCGCCGt > 1:2724753/1‑150 (MQ=255) aGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTAAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAGCGCCGt > 2:4381925/1‑150 (MQ=255) | CTTGCCGGCCGCGCGCGAACTGGCACGCTTCGGCATCCGTGTGATGACCATCGCTCCGGGTATCTTTGAAACCCCTATGATGGCCGGCATGAGCGATGAGGTACGTGCTTCGCTGGCTGCCGGCGTGCCGTTCCCGCCCCGCTTGGGCCGCCCGCAGGAATACGCCGCGCTGGCCCGCCACATCATCGAGAACAGCATGCTCAACGGTGAGGTCATCCGCCTCGACGGTGCGCTGCGCATGGCTGCCAAGTAAGGAGAGCGAACATGACCCTCGCCAATGACCCCATCGTTATCGTCAGCGCCGT > NC_002947/2527458‑2527762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |