| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5543111 = | 95 (0.620) | 5 (0.040) | 4/242 | NT | 5.5% | intergenic (‑156/+160) | PP_4872/dnaB | hypothetical protein/replicative DNA helicase |
| ? | NC_002947 | 5543227 = | 90 (0.670) | intergenic (‑272/+44) | PP_4872/dnaB | hypothetical protein/replicative DNA helicase | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCGATGGGGCCGTTACGC > NC_002947/5543078‑5543373 | gcgcCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATgg < 2:3699364/150‑1 (MQ=255) ccTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCt < 2:4072140/150‑1 (MQ=255) cTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTg > 2:3054203/1‑150 (MQ=255) cTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTg > 1:3549476/1‑150 (MQ=255) tgtgAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGc > 2:2867349/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAagca < 2:1162404/150‑1 (MQ=255) gatgcgcCGCGCGGGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAagcagc > 1:1647065/4‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGcc > 1:3666551/1‑150 (MQ=255) ccgcgcggGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTAc > 1:4247962/1‑150 (MQ=255) ccgcgcggGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTAc > 1:4247956/1‑150 (MQ=255) cccgcGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAg < 1:3925586/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGcc > 2:2576958/1‑150 (MQ=255) cggcgCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGcccc < 2:1985105/150‑1 (MQ=255) cggcgCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGcccc < 2:4300020/150‑1 (MQ=255) ggcgCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCt < 2:3709068/150‑1 (MQ=255) cgcATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGc < 1:4914096/150‑1 (MQ=255) gaATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACTTTTGTTGCAACGTGCAAAAACTGCAAGGCCTTGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCt > 1:3184249‑M1/3‑150 (MQ=255) atcgcgacgcaaggcccacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcaatgGGCTGCAAAGCAGCCCCTCCCCGGGCCCCTgctcc > 2:1909014‑M2/116‑148 (MQ=255) 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AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGt < 1:1641395‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGt > 2:3666551‑M1/1‑150 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGt < 1:2972727‑M1/150‑1 (MQ=255) AGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGtt > 1:4918317‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTa > 1:3722025‑M1/1‑150 (MQ=255) 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cgCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGc < 1:3460145/150‑1 (MQ=255) cgCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGc > 2:2080077/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGAt < 2:4055805/150‑1 (MQ=255) ttGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGAt > 1:2659002/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACg > 2:4727888/1‑150 (MQ=255) aaaCGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACg > 2:4239253/1‑150 (MQ=255) aCGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCgg < 1:1865663/122‑1 (MQ=255) aCGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCgg > 2:1865663/1‑122 (MQ=255) aCGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCa < 2:966136/150‑1 (MQ=255) aCGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCa < 2:3538117/150‑1 (MQ=255) cGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCCGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCAc < 1:503886/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAg > 1:2738387/1‑150 (MQ=255) gtgGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGc > 1:1912861/1‑150 (MQ=255) gtgGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGc > 1:1912625/1‑150 (MQ=255) gtgGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGCCGCCAAGTACTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGc > 2:4997586/1‑150 (MQ=255) gggCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGgt > 2:3415037/1‑116 (MQ=255) gggCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGgt < 1:3415037/116‑1 (MQ=255) gggCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCg > 1:349681/1‑150 (MQ=255) tcgcgatgGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCGATGGGGCCGt > 1:430751‑M2/9‑150 (MQ=255) taggGGCTGCTTTGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCGATGGGGCCGTTACg > 2:4404735‑M2/5‑150 (MQ=255) gatgGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCGATGGGGCCGTTACg > 1:2090753‑M2/5‑150 (MQ=255) atgGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATAATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCGATGGGGCCGTTACGc > 2:1357121‑M2/4‑150 (MQ=255) | GCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTCATCATCATCAAAGTTGTACATCCCCGGCGCCAAGTTCTCGAACCGGGTGTACTTGCCGATAAACGCCAAACGCACGAAGCCGATGGGGCCGTTACGC > NC_002947/5543078‑5543373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |