New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2306946 = | 57 (1.080) | 3 (0.060) | 3/264 | 3.7 | 4.7% | coding (1576/1719 nt) | PP_2028 | TPR repeat‑containing protein |
? | NC_002947 | = 4018882 | 65 (1.230) | coding (818/1410 nt) | PP_3544 | GntR family transcriptional regulator | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTTCCTGATGCAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCT > NC_002947/2306814‑2307078 | tttCCTGATGCAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGGCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTgg < 1:162072/136‑1 (MQ=255) tttCCTGATGCAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTgg < 1:1318506/136‑1 (MQ=255) gATGCAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTg < 1:436491/136‑1 (MQ=255) cAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATg < 2:1314378/136‑1 (MQ=255) cAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATg > 2:65525/1‑136 (MQ=255) cAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATg < 2:802060/136‑1 (MQ=255) cggTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTg < 1:682299/134‑1 (MQ=255) cTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTg > 1:418406/1‑136 (MQ=255) tGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTgt < 1:228411/136‑1 (MQ=255) aTACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCAATCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGATGTTCGACGTCGAGGCTGGACGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGtcgtcg > 1:867862/1‑136 (MQ=255) ccAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTc < 1:362302/136‑1 (MQ=255) cAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTcc < 1:1096215/136‑1 (MQ=255) aGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTAGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCAccc > 2:1010184/1‑136 (MQ=255) gAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCg > 1:1163335/1‑136 (MQ=255) gcTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGggc < 1:198376/136‑1 (MQ=255) gcTCTGCCGGGGTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGggc < 2:923723/136‑1 (MQ=255) gTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTtg < 2:827457/136‑1 (MQ=255) gggATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTtgctgc > 2:40489/1‑136 (MQ=255) ccccGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCttt < 1:1246995/135‑1 (MQ=255) cccGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTc > 1:937755/1‑136 (MQ=255) ccGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTTCTGCTTTCg > 2:544833/1‑136 (MQ=255) gCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGcc < 1:44820/136‑1 (MQ=255) cATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGTGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGAGACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTTGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGgtt < 1:929536/136‑1 (MQ=255) cATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGGGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGgtt < 1:534818/136‑1 (MQ=255) cATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGgtt < 2:1262461/136‑1 (MQ=255) cATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGgtt < 2:799852/136‑1 (MQ=255) cATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGCTGCTGCTGCTTTCGCCGGgtt < 1:452980/136‑1 (MQ=255) cTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTggg > 1:934444/1‑135 (MQ=255) cgcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGgttg > 1:6423/1‑119 (MQ=255) cgcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGgttg < 2:6423/119‑1 (MQ=255) cgcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGtt > 1:763857/1‑136 (MQ=255) cgcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGtt > 2:971629/1‑136 (MQ=255) gcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGc < 2:482701/93‑1 (MQ=255) gcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGc > 1:482701/1‑93 (MQ=255) gcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTg > 2:989096/1‑136 (MQ=255) gcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTg > 1:839288/1‑136 (MQ=255) gcTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGGTGTTCGGGGCTGGCCTGTTg > 1:201765/1‑136 (MQ=255) gcTGTGCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTg < 2:1269224/136‑1 (MQ=255) gTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGgtc < 1:40489/136‑1 (MQ=255) ttCGCCGTCGAGGCTGGGCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGgtcg < 1:1237395/136‑1 (MQ=255) cGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGgtcgtg > 1:114115/1‑135 (MQ=255) ggcGAGGCTGGTCGTCACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGTTGACTCTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGATGCTTTCGCCGTGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCg < 1:615818/134‑1 (MQ=255) ggcGAGGCTGGTCAACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTCGTCGTCGCCg < 2:1242643/134‑1 (MQ=255) gTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCg < 1:468582/136‑1 (MQ=255) gTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCg < 2:1319670/136‑1 (MQ=255) ggCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGgtgt > 2:38038/1‑136 (MQ=255) acacCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCGTTGGGc > 2:299881/1‑136 (MQ=255) acacCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGc > 2:674342/1‑136 (MQ=255) acacCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGc > 2:1340987/1‑136 (MQ=255) acacCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCAGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGc > 2:456326/1‑136 (MQ=255) acacCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCCGCCAGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCAGTTGCTGCTGCTTTCGACGGGGTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGc > 2:284348/1‑136 (MQ=255) cacCGGGCGCGGTGGCGGCTGGATGACACGGGCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGcc < 1:197070/136‑1 (MQ=255) cGGGCGCGGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCggg < 1:42592/136‑1 (MQ=255) cgcTGTGGCGGCTGGATGACTCTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTGGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGgctgc < 1:1106748/136‑1 (MQ=255) cgcTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGgctgc < 2:1163335/136‑1 (MQ=255) gcTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGgctgct > 2:353790/1‑136 (MQ=255) gcTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGgctgct > 2:884696/1‑136 (MQ=255) gcTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCAGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCGGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGgctgct > 1:1348621/1‑136 (MQ=255) | TTTCCTGATGCAATTGCTGTTCATACCAGAATTTGCGTCGCAGCAGCTCTGCCGGGTTGTCGGGGATTTCCCGCAGCCATTGCTCCAGGGCTTGGCGCTGTTCGCCGTCGAGGCTGGTCGACACCGGGCGCTGTGGCGGCTGGATGACACTGTCGTCGCTCCCGGCCTGGTTGCCGGGGGCGGCCTGGCTGTTGCTGCTGCTTTCGCCGGGTTGTTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCT > NC_002947/2306814‑2307078 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |