| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1735952 = | 215 (1.310) | 13 (0.080) | 7/256 | NT | 5.9% | coding (614/1206 nt) | csdA | cysteine desulfurase |
| ? | NC_002947 | 1736012 = | 210 (1.340) | coding (554/1206 nt) | csdA | cysteine desulfurase | |||||
CACTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1736105‑1735952‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcatggGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAG > NC_002947/1736012‑1736160 CACTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGC > 2:854654/1‑150CACTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGC < 1:3065899/150‑1 ACTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCA > 2:1694915/1‑150 CTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCAT < 1:2172509/150‑1 CTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCAT < 1:4613259/150‑1 CTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCAT < 1:541798/150‑1 TGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATG < 1:4122832/150‑1 CTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCA > 1:3306317/1‑150 TGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGCGG‑GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTG > 1:4482859/1‑150 TGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGCGG‑GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTG > 1:4482866/1‑150 CCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACA < 1:2110996/100‑1 CCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACA > 2:2111013/1‑100 CCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACA > 2:2110996/1‑100 CCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACA > 2:2110923/1‑100 CCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACA < 1:2111013/100‑1 CCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACA < 1:2110923/100‑1 CGCGCCCACGGCGAGCAGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGG‑GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGATGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGATCCTG > 2:2297640/1‑150 GCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGCGG‑GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTC > 1:2530283/1‑150 TGGTCGATGGTGCCCAGGGCGCGG‑GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGG < 2:4482859/150‑1 TGGTCGATGGTGCCCAGGGCGCGG‑GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGG < 2:4482866/150‑1 GCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGG > 1:3368741/1‑150 GGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCA > 2:1010617/1‑150 GGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCA > 2:2562150/1‑150 GGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCA < 2:528964/150‑1 GGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAG < 2:1858783/150‑1 GGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAG < 2:5416144/150‑1 GGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAG > 2:713032/1‑150 CACTGCAACTGATCGGCCCGCGCACCCGAGTGCTCGCCATCAGCCAGCTGTCCAACGTGCTGGGTACCTGGCAACCGCTGCCAGCGCTGCTGGCCCATGCCCGCGCCCAGGGCGCGCTGACGGTGGTCGATGGTGCCCAGGGCGTGGTGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1736105‑1735952‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcatggGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAG > NC_002947/1736012‑1736160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |