New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1735952 = | 215 (1.310) | 13 (0.080) | 7/256 | NT | 5.9% | coding (614/1206 nt) | csdA | cysteine desulfurase |
? | NC_002947 | 1736012 = | 210 (1.340) | coding (554/1206 nt) | csdA | cysteine desulfurase |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
CATAGAGCACGCCGACGCCGTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAGG > NC_002947/1735863‑1736161 | cATAGAGCACGCCGACGCCGTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGGCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATggg < 2:1451583/150‑1 (MQ=255) aTAGAGCACGCCGACGCCGTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGc > 1:879327/1‑150 (MQ=255) tgatcggcccgcgcacccgagtgctcgccatcagccagctgtccaacgtgctgggtacctggcaaccgctgccagcgctgctggcCCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCcag > 1:3306317‑M1/86‑150 (MQ=255) gCACGCCGACGCCGTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCcagca > 2:943778/1‑150 (MQ=255) acgccgacgccgTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACCCATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCCCGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCagcagc < 2:2395259/150‑1 (MQ=255) acgccgacgccgTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCagcagc < 2:4919137/150‑1 (MQ=255) gccgacgccgTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAgcgc > 2:2009129/1‑150 (MQ=255) ccgacgccgTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCt < 1:1607634/150‑1 (MQ=255) gacgccgTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTgg < 2:1684787/150‑1 (MQ=255) cgTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCGCTGCTGGcccat < 2:5161595/150‑5 (MQ=255) ggACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGc < 1:2074573/150‑1 (MQ=255) gACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGACGTCGCAGCCCAGGTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGcc < 1:4165216/150‑1 (MQ=255) aCCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCa < 1:4035999/150‑1 (MQ=255) aCCGTACAGCGTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCa < 1:152511/150‑1 (MQ=255) ccGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAg < 2:2509436/150‑1 (MQ=255) tACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTa > 1:1027053/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGtt < 2:3097772/150‑1 (MQ=255) cTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTg < 2:3807546/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gctgcATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTgc > 1:5155423/1‑150 (MQ=255) ctgcATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGGTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTgcg > 2:3819948/1‑150 (MQ=255) gcATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGcgcg > 2:645575/1‑150 (MQ=255) tGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGc < 2:5447332/150‑1 (MQ=255) tGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGc < 2:3472048/150‑1 (MQ=255) 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cTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGcctggtcctg < 2:4048261/150‑1 (MQ=255) cTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGcctggtcctg < 1:269343/150‑1 (MQ=255) gggCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGcctggtcctggt < 2:4890500/150‑1 (MQ=255) gggCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGcctggtcctggt < 2:4125062/150‑1 (MQ=255) ggCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCctggtcctggtc < 1:3611516/150‑1 (MQ=255) cATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCCTGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATAc > 2:4629486/1‑150 (MQ=255) cATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGcctggtc < 1:1400938/139‑1 (MQ=255) cATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATAc > 2:469940/1‑150 (MQ=255) tCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGa > 1:1745415/1‑150 (MQ=255) accaccGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCa > 2:4513064/1‑150 (MQ=255) caccGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATg < 1:2393682/150‑1 (MQ=255) accGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATgg < 2:1745188/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGTATCGACCaggacc < 2:1169613/150‑6 (MQ=255) cgcCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTg < 2:1132115/150‑1 (MQ=255) cgcCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTg < 2:2565744/150‑1 (MQ=255) gcCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCGGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTgg < 2:5066803/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGgca < 2:3090465/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGgcag < 1:1299269/150‑1 (MQ=255) tGGGAGCTGGCATGGGCCAGAAGAGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGATGGAAAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCAGATCACTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGAGTCAAGTGgcaga > 2:5086766/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGcac < 1:3788205/150‑1 (MQ=255) ctgcgGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGcacc > 1:528964/3‑150 (MQ=255) gcgGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGcaccac < 1:1966232/150‑1 (MQ=255) gggCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCAccacca > 2:2190378/1‑150 (MQ=255) gGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAg < 2:5416144‑M2/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTgcg > 2:1821265/1‑74 (MQ=255) gCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTgcg < 1:1821152/74‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAgg > 2:4408133/1‑150 (MQ=255) | CATAGAGCACGCCGACGCCGTCCGGACCGTACAGCTTGTGGCTGGAAAACACATAGAAGTCGCAGCCCAGTTGCTGCATGTCCTGGCGACCATGCACCACGCCCTGGGCACCATCGACCACCGTCAGCGCGCCCTGGGCGCGGGCATGGGCCAGCAGCGCTGGCAGCGGTTGCCAGGTACCCAGCACGTTGGACAGCTGGCTGATGGCGAGCACTCGGGTGCGCGGGCCGATCAGTTGCAGTGCCTGGTCCTGGTCGATACGACCATGGGCGTCCAGTGGCAGCACCACCAGGTGCAGG > NC_002947/1735863‑1736161 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |