New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4931764 | 141 (0.860) | 10 (0.070) | 5/246 | NT | 7.2% | coding (375/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
? | NC_002947 | = 4931822 | 130 (0.860) | coding (317/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
GCCTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4931606‑4931764 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttcggccaggTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGAGGCCGAG < NC_002947/4931822‑4931674 GCCTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGT > 2:1643654/1‑150 CTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTC > 2:3293824/1‑150 CTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTC < 2:1341132/150‑1 CTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTC < 1:693897/150‑1 CTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTC < 1:4974922/150‑1 TTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCG < 1:5146330/150‑1 TGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGG < 2:224559/150‑1 TGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGG < 1:2425777/150‑1 GATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGC < 1:1933478/150‑1 GATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGC > 1:48947/1‑150 ATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCC < 1:4919460/150‑1 TCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCA > 1:2803743/1‑150 TCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCA > 1:1275746/1‑150 GCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGG > 2:4584704/1‑150 GAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGC > 2:570307/1‑150 GAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGC > 2:570338/1‑150 TCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGG < 1:3468725/110‑1 TCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGG > 2:3468725/1‑110 CTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCG > 2:20376/1‑150 GGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTG < 1:20376/150‑1 CCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGC < 1:570338/150‑1 CCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGC < 1:570307/150‑1 CCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGC < 2:2112864/150‑1 CCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGC < 2:2777282/150‑1 GCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAAC < 2:209955/150‑1 CGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTTCGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGG < 2:2523035/150‑1 CGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGG < 2:5422509/150‑1 CGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGG < 2:5249925/150‑1 GTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGC < 2:950958/150‑1 TTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCTAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCG < 1:4196509/66‑1 TTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCC > 2:390769/1‑150 CGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGA < 2:1595983/150‑1 CGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGA < 2:1595976/150‑1 CGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGA < 2:1595945/150‑1 GCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGAGG < 2:2372195/150‑1 GTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGAGGCCGAG > 1:4657718/1‑150 GCCTTGATCGCATCGAGCGAATCGAGCAACTGCTCGAACTCACTGTCAGTGATGTCCTGGTGTTGCTCCTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4931606‑4931764 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttcggccaggTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGGGGCAGCCGAAGCTGTTGCAGCGCCCGTACCGGCACCGGTTGCCGACGTGGTGGCTGCAGCGCCGGCCGAGGCCGAG < NC_002947/4931822‑4931674 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |