New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4931764 | 141 (0.860) | 10 (0.070) | 5/246 | NT | 7.2% | coding (375/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
? | NC_002947 | = 4931822 | 130 (0.860) | coding (317/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAA > NC_002947/4931674‑4931970 | ctcggcctcggcCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCAc > 1:4657718‑M2/1‑149 (MQ=255) tcggccGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCAcctggccg < 2:1595976‑M2/150‑9 (MQ=255) tcggccGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCAcctggccg < 2:1595983‑M2/150‑9 (MQ=255) ggccggcGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCAcctggccgaa > 2:390769‑M2/1‑140 (MQ=255) ccggcGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACa < 1:1095844/150‑1 (MQ=255) cggcGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACAt < 2:3241946/150‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCt < 1:1355706/150‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCt < 2:2682473/150‑1 (MQ=255) gcTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTg < 2:689910/150‑1 (MQ=255) gcTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTg < 2:4646380/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGtt < 1:4883599/150‑1 (MQ=255) cAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGa > 1:3133326/1‑150 (MQ=255) aGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGAc < 2:1242739/150‑1 (MQ=255) accacGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTa > 1:1118177/1‑150 (MQ=255) cacGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATc < 2:506875/150‑1 (MQ=255) acGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATcc < 1:1242866/150‑1 (MQ=255) cGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCa < 2:3773704/150‑1 (MQ=255) gTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAg < 1:187181/150‑1 (MQ=255) 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aaCCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGtt < 2:4997667/132‑1 (MQ=255) aaCCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTc > 2:978199/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTc < 1:1517780/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCg > 1:1591586/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCg > 2:4906693/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAg > 2:4924483/1‑150 (MQ=255) ggTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGc < 2:158845/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCAGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGca < 2:1349608/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGcacc < 1:772318/150‑1 (MQ=255) gTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCAcat > 1:2676663/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCAcatccatc < 2:4446381/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCa < 2:3116432/150‑1 (MQ=255) cgcTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAg > 1:3766989/1‑150 (MQ=255) gcTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGt > 2:906143/1‑150 (MQ=255) tGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTc < 1:1141111/150‑1 (MQ=255) 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ggTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGgca < 2:4690791/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCGGTGTCACGTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCCGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCCTCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGgca < 2:1275684/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGgcag < 1:1118718/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGgcag > 1:2425442/1‑150 (MQ=255) cGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTc < 1:3293824/150‑1 (MQ=255) tgtCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTccac > 2:1805219/1‑150 (MQ=255) aCTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGc > 2:3473144/1‑150 (MQ=255) aCTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGc > 1:3624610/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCt > 2:2115206/1‑150 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGatat > 1:5118350/1‑131 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGatat < 2:5118350/131‑1 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTc < 1:2572624/150‑1 (MQ=255) cGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCttt > 1:1639064/1‑97 (MQ=255) cGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCttt < 2:1639064/97‑1 (MQ=255) gCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTc > 2:1433906/1‑150 (MQ=255) cACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCa < 1:2346063/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCt > 2:4935939/1‑150 (MQ=255) gCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCt > 2:2706117/1‑150 (MQ=255) cgcgCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTgaa < 1:3614460/150‑1 (MQ=255) cgcgCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTgaa < 2:3873592/150‑1 (MQ=255) gcgcAcctggccgaacctggggcagccgaagctgttgcagcgcccgtaccggcaccggttgccgacgtggtggctgcagcgccggccgaggccgaggagcaacaccaggacatcactgacagtgagttcgagcagttgctcgattcgctc > 2:570307‑M2/1‑5 (MQ=255) | CTCGGCCTCGGCCGGCGCTGCAGCCACCACGTCGGCAACCGGTGCCGGTACGGGCGCTGCAACAGCTTCGGCTGCCCCAGGTTCGGCCAGGCGCGACAGCGCTGCCAGCAGCGCCGGGGTGGCCGGTGTCACTTCGGCACGCTCGCGCACCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAA > NC_002947/4931674‑4931970 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |