New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 100507 | 132 (0.920) | intergenic (‑99/+23) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAAT > NC_002947/100311‑100608 | cccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCt > 1:1341131/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:3366979/1‑150 (MQ=255) gcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCccgcgaa > 1:2343209‑M1/131‑147 (MQ=255) tGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 2:877025/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 2:1843500/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGt > 1:4022467/1‑150 (MQ=255) aGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTaaa < 2:3955941/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTaaa < 1:2548787/150‑1 (MQ=255) gTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCa < 2:5229884/150‑1 (MQ=255) gTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCa > 1:5157821/1‑150 (MQ=255) cTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGc > 1:464076/1‑150 (MQ=255) gATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGc < 2:4157887/147‑1 (MQ=255) cgagcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGaa < 1:1964672/150‑1 (MQ=255) agcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgg > 2:2196125/1‑150 (MQ=255) tgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAggg < 2:4704326‑M1/47‑1 (MQ=255) cgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgggg < 2:1748811/150‑1 (MQ=255) cgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgggg < 2:2886853/150‑1 (MQ=255) cgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACGTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgggg > 2:2377256/1‑150 (MQ=255) 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gtcggtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACGTGAGTGCTGCGTGGCCTTCGTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcg > 2:2834517‑M2/1‑147 (MQ=255) tcggtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgg > 1:5399417‑M2/1‑146 (MQ=255) cggtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcggg > 2:3804333‑M2/1‑145 (MQ=255) tgtcaGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggc < 2:840159‑M1/149‑55 (MQ=255) tctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGgggcgggc > 1:4704326‑M1/80‑150 (MQ=255) 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CGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCGGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcgc > 2:3165206‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCt > 1:2150783‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTg < 1:5269345‑M1/150‑1 (MQ=255) gCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccct < 2:707644‑M1/150‑141 (MQ=255) aTGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctga < 2:997367‑M1/150‑143 (MQ=255) aTGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctga < 2:664502‑M1/150‑143 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcccccgcaaaacatccgcttcgacctcgacggcaccctga < 1:3866187‑M2/150‑95 (MQ=255) tGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacgacaccctgac < 1:3228691‑M1/150‑144 (MQ=255) tGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgac < 1:5391244‑M2/150‑96 (MQ=255) GCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCgg < 2:3151961‑M1/76‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgaccg < 1:1985913‑M2/150‑98 (MQ=255) ccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgaccga > 2:4449503‑M1/1‑4 (MQ=255) ccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgaccga > 2:4449442‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgaccga < 2:1266597‑M2/150‑99 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGaaa < 1:287286‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGaaa < 2:4269014‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGaaa < 2:1990749‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGACACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCAGGCGCTGTAGGAGaaa < 2:1568061‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgacgaa < 1:4323957‑M2/70‑21 (MQ=255) GCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCgcgaagaa > 2:4323957‑M1/1‑67 (MQ=255) CTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAAt < 1:307506‑M1/150‑1 (MQ=255) | CCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAAT > NC_002947/100311‑100608 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |