New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 507088 | 157 (1.070) | intergenic (+97/+36) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
CGGTGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCA > NC_002947/506877‑507175 | cGGTGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGT > 1:4853035‑M1/1‑150 (MQ=255) gaggcggcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTaa > 1:3654030/3‑150 (MQ=255) ggcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGCCTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCg < 2:186615/150‑1 (MQ=255) ggcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCg < 2:807484/150‑1 (MQ=255) ggcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCg > 2:4558085/1‑150 (MQ=255) ggcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCg > 1:2012061/1‑150 (MQ=255) gcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGc < 2:4104639/150‑1 (MQ=255) cATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:2890088/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:5153700/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:652591/1‑150 (MQ=255) gCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:2146988/150‑1 (MQ=255) gCCGACTCGGTGCCGGCACTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:4911242/150‑1 (MQ=255) ccGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAg < 2:1142040/150‑1 (MQ=255) cGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAAc > 2:3510339/1‑136 (MQ=255) cGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAgg > 2:3693347/1‑150 (MQ=255) aCTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGtt < 1:3265333/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGtt < 1:3755532/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGtt < 1:1713286/150‑1 (MQ=255) 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ttgattgGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAAcc < 1:2189637/150‑1 (MQ=255) gaatgggCTGCGCAGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAAccccc > 1:4040331/5‑150 (MQ=255) attgGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAAccccc > 2:2836543/1‑150 (MQ=255) tgggCTGCGCAGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCCAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAAGTCAGAAGTCCACGCGAACCCCCACg > 1:666427/2‑150 (MQ=38) gggCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGc > 2:4625470/1‑150 (MQ=255) 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cATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCATGTTGCGt > 2:2591269/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaac > 2:1818884‑M1/1‑10 (MQ=255) aTTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaac > 2:740376‑M1/1‑10 (MQ=255) aTTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaac > 2:4881653‑M1/1‑10 (MQ=255) aTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTc > 2:5272859/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcgga < 2:3185605‑M1/118‑110 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCa > 2:3948085/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCaa < 1:4625470/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCaa < 1:885852/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCaa < 2:501276/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACt < 2:147364/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtca > 1:3636824/1‑150 (MQ=255) ggTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagccgccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaatgccaccgcacggaacatcgccc > 2:3347308‑M1/1‑3 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgccc < 1:3113808‑M2/150‑86 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcat < 2:540926/150‑1 (MQ=255) gTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctg > 1:1258622‑M1/1‑2 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcatc > 1:3879200/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa > 1:3344616/1‑104 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcatca < 1:4858626/150‑1 (MQ=255) | CGGTGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCA > NC_002947/506877‑507175 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |