| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 507026 | 154 (0.940) | 10 (0.070) | 5/240 | NT | 6.4% | intergenic (+35/+98) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
| ? | NC_002947 | = 507088 | 157 (1.070) | intergenic (+97/+36) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP | |||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGCTCAC > NC_002947/506942‑507234 | ggCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCaccc < 2:1386327‑M2/150‑5 (MQ=255) tGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 1:2506512‑M2/1‑141 (MQ=255) gTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaat > 2:4881653‑M2/1‑140 (MQ=255) gTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaat > 2:1818884‑M2/1‑140 (MQ=255) gTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaat > 2:740376‑M2/1‑140 (MQ=255) tCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaatgg > 2:456074‑M2/1‑138 (MQ=255) gTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGcc > 2:2411499/1‑150 (MQ=255) gTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGcc > 1:1464103/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa < 1:998250/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATCCGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCg < 1:968474/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGc > 2:4620795/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGc < 1:4947355/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCa < 1:4351122/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGTTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGccccttc < 1:2029167/150‑4 (MQ=255) cAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCac > 1:1258622‑M2/1‑115 (MQ=255) cAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCac < 2:1258622‑M2/117‑3 (MQ=255) aGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAAtt < 1:5222958/150‑1 (MQ=255) aCTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCa < 2:4319387/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 2:1590897/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 2:3185605‑M2/118‑10 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 1:3185605‑M2/1‑109 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 1:1048334/150‑1 (MQ=255) cGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGt > 1:3130164/1‑150 (MQ=255) gCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTc < 2:2212589/150‑1 (MQ=255) aGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCAc > 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ggCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCt < 1:1315004/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTaa < 2:3783847/150‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATa > 1:732055/1‑150 (MQ=255) gctgcGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATa > 1:2091107/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATAccc < 2:2170942/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATAccc < 2:4242344/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATAccc > 1:1787929/1‑150 (MQ=255) cgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCt < 2:302799/150‑1 (MQ=255) gcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTg < 1:3782478/150‑1 (MQ=255) aGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGtt < 2:3039073/150‑1 (MQ=255) 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gggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtca > 1:3636824/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgccc < 1:3113808‑M2/150‑86 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcat < 2:540926/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcatc > 1:3879200/1‑150 (MQ=255) tAACCCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCTTAGGTGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcatca < 1:4858929/150‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 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cggCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGc < 1:1923878/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGc < 2:4927959/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGcca > 1:2271368/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTCGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGcca < 1:3882662/150‑1 (MQ=255) cctcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGccacc > 1:1119664/3‑150 (MQ=255) ttcgcggGTAAacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttgatggtttcttcccattccagcgccggcaccgagtcggcaacga < 2:4316164‑M2/147‑140 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCAt < 2:3871839/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCAt < 2:2953997/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATg > 2:3062799/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTACTACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATgg < 1:2073278/150‑1 (MQ=255) aGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATgg < 2:3660697/150‑1 (MQ=255) aGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATgg < 2:2718909/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGc > 1:4949567/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGc > 2:963711/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACACTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATgg < 1:3049050/149‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGCCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCATATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGc < 1:4719777/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGccacca > 1:1877760/1‑140 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGCTcac > 2:4699591/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGCTcac > 1:2277530/1‑150 (MQ=255) | GGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCACCAGTTCATGGCTCAC > NC_002947/506942‑507234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |