| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 653522 = | 212 (1.290) | 13 (0.080) | 12/256 | NT | 6.2% | coding (1224/1962 nt) | ctpL | methyl‑accepting chemotaxis protein CtpL |
| ? | NC_002947 | 653570 = | 189 (1.200) | coding (1176/1962 nt) | ctpL | methyl‑accepting chemotaxis protein CtpL | |||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CCGACAGGCTCTGGCCGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTC > NC_002947/653374‑653671 | tttcgcccaagccatcgccctgggcaagaccaaccgcgaactgcacgacatccaggagtcgctcaaccgcctgcgtcagtacctggtggagctggtcggcaccatccgtcataatgccgagcaggtggccggcagcagccatgccctggc < 2:2113923‑M1/2‑1 (MQ=255) gACAGGCTCTGGCCGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCg > 2:2857992/1‑150 (MQ=255) gcccaagccatcgccctgggcaagaccaaccgcgaactgcacgacatccaggagtcgctcaaccgcctgcgtcagtacctggtggagctggtcggcaccatccgtcataatgccgagcaggtggccggcagcagccatgccctggccggc > 2:3978281‑M1/145‑150 (MQ=255) cAGGCTCTGGCCGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGc > 1:3118870/1‑150 (MQ=255) ctctGGCCGATTACCTCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGt < 1:5156818/150‑1 (MQ=255) tGGCCGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGc > 1:4542777/1‑150 (MQ=255) ccGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCg < 2:4186917/150‑1 (MQ=255) cGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCg < 2:2831962/149‑1 (MQ=255) gATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGgc > 1:3332493/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGccgccg > 1:4338090/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGccgccg < 1:3238305/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagc < 2:3794729/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagc < 2:3794717/150‑1 (MQ=255) caaccgcgaactgcacgacatccaggagtcgctcaaccgcctgcgtcagtacctggtggagctggtcggcaccatccgtcataatgccgagcaggtggccggcagcagccatgccctcGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagcg < 1:1314576‑M1/32‑1 (MQ=255) cTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagcg > 1:512283/1‑150 (MQ=255) ttGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagcgc > 1:5031232/1‑150 (MQ=255) ttGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagcgc > 1:687499/1‑150 (MQ=255) tGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTgcagcgca < 2:556126/150‑1 (MQ=255) 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cacgacatccaggagtcgctcaaccgcctgcgtcagtacctggtggagctggtcggcaccatccgtcataatgccgagcaggtggccggcagcagccatgccctgGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGcc > 2:813694‑M1/106‑150 (MQ=255) aCGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCGGTGCAGCGCAGCGCTGATGcc < 1:2255201/150‑1 (MQ=255) cGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGACGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCg < 1:4259877/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCgg > 1:5414135/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCgg > 2:3123651/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ttCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTccac > 1:3073613/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTccac > 1:3607216/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTccacca < 1:345849/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTccacca < 2:4316646/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGAGGGTGCCGACCAGCTccacca > 2:3019952/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAg > 1:3735704/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGt > 2:4576738/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGc < 2:1770566/134‑1 (MQ=255) ccAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAgg < 1:3430021/143‑1 (MQ=255) ccAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAgg > 2:3430021/1‑143 (MQ=255) ccAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGAc > 1:4400142/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCa > 1:4858169/1‑77 (MQ=255) aGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCa > 2:415248/1‑150 (MQ=255) gCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGCGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAgg < 1:1423884/150‑1 (MQ=255) cATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGc < 1:2857992/150‑1 (MQ=255) tCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCgg > 2:4104751/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCgg < 1:3973011/150‑1 (MQ=255) cgGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTg < 2:2729625/150‑1 (MQ=255) ggATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGa < 2:1683553/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGc < 1:918685/150‑1 (MQ=255) tCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTg > 1:2815787/1‑142 (MQ=255) tATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGa > 2:3331025/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGt > 2:7832/1‑150 (MQ=255) | CCGACAGGCTCTGGCCGATTACCGCCTGGCCTTGTTCCACCGCACGCCCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTC > NC_002947/653374‑653671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |