| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 653522 = | 212 (1.290) | 13 (0.080) | 12/256 | NT | 6.2% | coding (1224/1962 nt) | ctpL | methyl‑accepting chemotaxis protein CtpL |
| ? | NC_002947 | 653570 = | 189 (1.200) | coding (1176/1962 nt) | ctpL | methyl‑accepting chemotaxis protein CtpL | |||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
CCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTGGGCGAAATC > NC_002947/653421‑653719 | ccGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGcc > 2:2934165/1‑150 (MQ=255) cGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCa < 2:668929/150‑1 (MQ=255) ggCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAg > 2:694611/1‑150 (MQ=255) gcgGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATg > 1:1139543/1‑150 (MQ=255) gcgGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATg > 2:2800127/1‑150 (MQ=255) gcgGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATg > 2:2956132/1‑150 (MQ=255) cgGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATgg < 1:2498709/150‑1 (MQ=255) cgGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATgg < 2:4352531/150‑1 (MQ=255) cgGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATgg < 1:1383014/150‑1 (MQ=255) agtcgctcaaccgcctgcgtcagtacctggtggagctggtcggcaccatccgtcataatgccgagcaggtggccggcagcagccatgccctcGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATgg > 1:3571866‑M1/93‑150 (MQ=255) cTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATg > 1:1570153/1‑146 (MQ=255) tGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGgctgc > 2:4098533/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCtgctgc > 1:413339/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCtgctgc > 1:4046096/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGcc < 2:5424571/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCg > 1:783472/1‑150 (MQ=255) ggcggcTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGc < 2:3872598/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCt > 2:849950/1‑150 (MQ=255) 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aTCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCAtt > 1:4651651/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGa > 1:3417340/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGa < 2:2386753/150‑1 (MQ=255) ccAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGa > 1:2894907/1‑150 (MQ=255) aGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACg > 2:3275581/1‑150 (MQ=255) 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ttgttgAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGt < 2:452645/150‑1 (MQ=255) tgttgAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTg < 1:4970535/150‑1 (MQ=255) tgttgAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTg < 1:68822/150‑1 (MQ=255) gttgAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGc < 2:4651651/150‑1 (MQ=255) gAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGa < 2:5334471/150‑1 (MQ=255) 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GGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTg > 2:4108760‑M1/1‑150 (MQ=255) atgagcgctgcgctgcacggcggcgccgcgctcatgccggcCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGt > 2:2826448‑M2/42‑150 (MQ=255) gTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGtt < 2:510948/150‑1 (MQ=255) tCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTc > 2:3980364/1‑150 (MQ=255) gcGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCAGCTCGGCATTATGCCGGATGGTGCCGACCAGCTCCCCCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCgg < 1:5443399/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGt < 1:2243043/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGttt < 2:3031218/150‑2 (MQ=255) gcgcCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTg < 1:3123651/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTg < 2:1999188/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTgg < 1:4576738/150‑1 (MQ=255) gccgccGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGt < 2:735040/150‑1 (MQ=255) gccgTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCtt > 1:686782/1‑150 (MQ=255) gccgTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCtt < 1:3315443/150‑1 (MQ=255) cagcgcagcgCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTg < 1:5336149/139‑1 (MQ=255) agcgcagcgcTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAgg > 1:3909523/1‑150 (MQ=255) agcgcagcgcTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAgg > 2:1466643/1‑150 (MQ=255) cgcagcgcTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGc > 2:4226308/1‑150 (MQ=255) agcgcTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCCGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGAt < 2:3833294/150‑1 (MQ=255) cTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCt < 2:1139543/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTgg < 2:375538/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTggg > 2:165285/1‑150 (MQ=255) gccggcCAGGGCATGGCTGCGGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGCTGGTGCCGACCAGCTCCACCCGGTACTGACGCCGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTGGGc < 2:4545297‑M2/144‑1 (MQ=255) cAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTGGGCGAAATc > 1:1735180/1‑150 (MQ=255) cAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTGGGCGAAATc > 1:2047475/1‑150 (MQ=255) | CCGGCATCGCGGCTGGCCTCGGCGGCTGCGCTGGCATCACCAGCCACTTGTTGAATGGTTGCTTCCAGCTCGCCCAAGGCATCGCGGATCTGTCCGGTATCGCCGGCCTGTCGCTCGGCGCCGCCGTGCAGCGCAGCGCTCATGCCGGCCAGGGCATGGCTGCTGCCGGCCACCTGCTCGGCATTATGACGGATGGTGCCGACCAGCTCCACCAGGTACTGACGCAGGCGGTTGAGCGACTCCTGGATGTCGTGCAGTTCGCGGTTGGTCTTGCCCAGGGCGATGGCTTGGGCGAAATC > NC_002947/653421‑653719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |