| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1936035 = | 165 (1.000) | 9 (0.060) | 6/254 | NT | 5.7% | coding (294/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1936065 = | 143 (0.920) | coding (324/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GGGGCCATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGC > NC_002947/1935886‑1936184 | ggggCCATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGtt > 1:1637580/1‑150 (MQ=255)ggggCCATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGtt < 2:5201931/150‑1 (MQ=255)ggggCCATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTCGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGtt < 2:4052390/150‑1 (MQ=255) gatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggcctggccacccagccccagcaggctgtggccaacgaaaCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTg > 1:2694827‑M1/110‑150 (MQ=255) caccgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTg < 2:2399526‑M1/2‑1 (MQ=255) accgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTgg < 2:2617281‑M1/3‑1 (MQ=255) accgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTgg < 2:357028‑M1/3‑1 (MQ=255) accgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTgg > 1:3421361‑M1/148‑150 (MQ=255) accgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTgg > 1:3617951‑M1/148‑150 (MQ=255) accgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTgg < 1:4178859‑M1/3‑1 (MQ=255) ccATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGcc < 2:5082777/150‑1 (MQ=255) ccATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGcc < 1:2511912/150‑1 (MQ=255) gcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTGGCca > 1:1266609‑M1/145‑150 (MQ=255) tCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCcac‑‑a < 2:4133371/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAGTTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGc < 2:1642891/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGc > 1:386128/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGc > 1:4005309/1‑150 (MQ=255) gactcgtagccaaaggcggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTGGc > 2:4923117‑M1/136‑139 (MQ=255) 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ccTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTgctggggct > 2:4178859/1‑150 (MQ=255) cTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTgctggggctg < 1:4470369/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTgctggggctgg < 2:499001/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTgctggggctgg < 1:561855/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCGGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTgctggggctgg < 2:2633763/150‑1 (MQ=255) 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< 2:1250433‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTg > 1:33693/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTgg < 1:834869/150‑1 (MQ=255) gCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGTCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGgc > 1:5191220/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCAt > 2:1282373/1‑135 (MQ=255) gCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGgc > 1:4917948/1‑150 (MQ=255) cccGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGgcc > 2:1543182/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTgctgg < 1:3047747/48‑1 (MQ=255) ccGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGgccg > 2:3232741/1‑150 (MQ=255) cGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGgccgc > 2:2111060/1‑150 (MQ=255) ggggTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCAAGGCGTGgccgat < 2:3079168/150‑3 (MQ=255) ggTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGa < 1:2567218/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGa < 1:2257330/150‑1 (MQ=255) tCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGc < 1:2705169/150‑1 (MQ=255) tCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGc > 2:3357273/1‑150 (MQ=255) gagcaacgccacgggggccTGGCCACCCAGCCCCAGCAGGCTG‑‑TGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTgc < 1:3964476‑M1/131‑1 (MQ=255) gccagCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGcc > 1:5350775/1‑150 (MQ=255) cagCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGt < 1:4275418/150‑1 (MQ=255) gCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTgg < 1:327055/150‑1 (MQ=255) cgTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCg < 1:4798832‑M2/148‑1 (MQ=255) gTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCgg < 1:610727‑M2/149‑1 (MQ=255) tttCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGt < 1:2778518/150‑1 (MQ=255) tttCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGt > 2:3786505/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCg > 2:1451270/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCg < 1:1543182/150‑1 (MQ=255) | GGGGCCATCAACGCCGTCACCCTGGCCAGTGGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGC > NC_002947/1935886‑1936184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |