| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1936035 = | 165 (1.000) | 9 (0.060) | 6/254 | NT | 5.7% | coding (294/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1936065 = | 143 (0.920) | coding (324/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGAC > NC_002947/1935916‑1936214 | cggtcaccgccacggcgcgcaggtgctcggcggccaaggcgtggccgatgccatccaggttcaggtgcgtttgcagcaggctgcgcaacgggctgctgtcgagcaacgccacgggggccTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAg > 2:2600795‑M1/120‑150 (MQ=255) tgcggtgcACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGc > 2:4205335/1‑150 (MQ=255) ggtgcACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGcccc > 1:897203/1‑150 (MQ=255) ggtgcACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGcccc > 1:3970180/1‑150 (MQ=255) ggtgcACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGcccc > 1:3970134/1‑150 (MQ=255) gtgcACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGccccc < 1:4918810/150‑1 (MQ=255) gcACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGt < 1:4867563/150‑1 (MQ=255) aCTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTgg < 2:3607186/150‑1 (MQ=255) ttCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCg > 1:50521/1‑150 (MQ=255) ttCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCg > 1:4841394/1‑150 (MQ=255) ttCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCg > 1:346880/1‑150 (MQ=255) cAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGtt < 1:4956054/150‑1 (MQ=255) aTGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGc < 2:621962/150‑1 (MQ=255) tGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCt < 1:1056174/150‑1 (MQ=255) tGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCt < 1:2772240/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGa > 1:5318118/1‑150 (MQ=255) ccGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGAca < 1:1391878/150‑1 (MQ=255) ccGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGAca > 1:3121817/1‑150 (MQ=255) 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aTTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGc > 2:327055/1‑150 (MQ=255) gCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGa > 1:98529/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGGTTCGTTGGCGAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCggg < 2:2341652/150‑1 (MQ=255) cTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGAt < 2:3321495/150‑1 (MQ=255) cATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCAt > 1:3012360/1‑150 (MQ=255) 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CAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCttt < 1:2523688‑M1/150‑1 (MQ=255) CAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCttt > 2:5332049‑M1/1‑150 (MQ=255) CAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCttt < 2:5276069‑M1/150‑1 (MQ=255) CAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCttt < 1:4115386‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGAAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACATGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTa > 1:4136417/1‑150 (MQ=255) ctgctgGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTAc < 2:386128/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTAc > 1:2867942/1‑150 (MQ=255) ctgctgGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTAc < 1:2320215/150‑1 (MQ=255) tgctgGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACg > 1:4731151/1‑150 (MQ=255) ggctgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTg < 1:2657512/150‑1 (MQ=255) gctgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTgg > 1:2399526/1‑150 (MQ=255) ctgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGt > 2:3333239/1‑150 (MQ=255) ctgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGt > 2:693980/1‑150 (MQ=255) tgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTc < 2:897203/150‑1 (MQ=255) tgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTc < 2:3970177/150‑1 (MQ=255) gggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCa < 2:1841686/150‑1 (MQ=255) tggccaGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGc < 2:1637580‑M2/144‑1 (MQ=255) ccaGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGt < 2:4917948‑M2/147‑1 (MQ=255) ccaGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGt > 1:3617731‑M2/4‑150 (MQ=255) ccaGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGt > 1:3421361‑M2/4‑150 (MQ=255) ccaGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGt < 2:2617281‑M2/147‑1 (MQ=255) aGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGa < 1:2261299‑M2/149‑1 (MQ=255) ggCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGAc < 2:4005340/150‑1 (MQ=255) ggCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGAc < 1:685721/150‑1 (MQ=255) | GGTGCGGTGCACTTCAATGACGCCGTGCAGCGGCTCACTGCCTTCTGGCAGAATTTCCGCAGCCATCTGGTCATCCGCAGCGACTGGCCCGGGGTCGTGCGCCAGGCCAGCCGTTTCGTTGGCCAC‑‑AGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTTTGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGAC > NC_002947/1935916‑1936214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |