New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2057943 | 117 (0.710) | 8 (0.060) | 5/236 | NT | 7.2% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
? | NC_002947 | = 2058017 | 104 (0.720) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGC > NC_002947/2057798‑2058091 | tCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:3752468/150‑1 (MQ=255) tGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:4857288/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:4555484/150‑1 (MQ=255) cACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:1216259/1‑150 (MQ=255) cACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:1240366/150‑1 (MQ=255) gCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAACACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:1090711/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg < 1:1809439/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg < 2:134098/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 2:4896281/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 2:3190537/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 1:5166215/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGa < 1:569355/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGa < 1:4678520/150‑1 (MQ=255) ccGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:1682674/141‑1 (MQ=255) gatgatGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTg > 2:1548897/1‑150 (MQ=255) tgatgGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGcc < 1:946219/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCa < 2:5367652/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGAAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAg < 2:1842726/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGAAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAg < 2:5203105/150‑1 (MQ=255) cATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGt < 1:4689294/150‑1 (MQ=255) cATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGt > 2:1669084/1‑150 (MQ=255) cGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGt > 2:2136871/1‑150 (MQ=255) aTGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAg < 2:2422010/150‑1 (MQ=255) aTGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCCCACCGACATTTGGATATAACTGCCCGCACGGGCAGTGACAg > 1:517443/1‑150 (MQ=255) aTGGACCACCAGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACGCCGGTGCTGGGCCTGCGCTGATCCAACTGCAACTGACTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCTACCTTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAg < 1:5082258/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAgg < 1:4344589/150‑1 (MQ=255) ggACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAggg > 1:4892862/1‑150 (MQ=255) accaccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTg > 2:3521635/1‑150 (MQ=255) caccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGaa < 1:3927163/150‑1 (MQ=255) caccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGaa > 1:2466131/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATcc < 1:4006585/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcgc < 2:5004808/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcgc < 1:4517729/150‑1 (MQ=255) gcCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtag < 1:3752473‑M1/150‑65 (MQ=255) gcCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAg < 1:4787775/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAg < 1:1500015/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCATAGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCgg < 2:4305980/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCggg > 1:5396117/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCAACAATGGGGTATAACAGCCCACACGTGCAGTGTCAGGGGGAAATCCCCCGAGGCGCggg > 1:2767850/1‑150 (MQ=255) gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggttt > 2:4199308‑M1/1‑76 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:4440397‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:1994249‑M2/1‑144 (MQ=255) gCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg > 1:2695999/1‑89 (MQ=255) gCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 2:2695999/89‑1 (MQ=255) ccGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg > 1:2922346/1‑86 (MQ=255) ccGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg < 2:2922346/86‑1 (MQ=255) ccGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGc > 1:1987630/1‑136 (MQ=255) ccGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGc < 2:4715128/136‑1 (MQ=255) ccGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGc < 2:1987630/136‑1 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:4199308‑M1/150‑84 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:4423283‑M1/150‑84 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:4423290‑M1/150‑84 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 1:4502569‑M2/150‑10 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 1:1330710‑M2/150‑10 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 2:2062518‑M2/1‑141 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 1:1351499‑M2/1‑141 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCaccctgtcact > 2:1303444‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 2:2184882‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAAGACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 1:4701616‑M2/1‑139 (MQ=255) tgCAAGTGAATACCCGGGTGGTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGTATAGCACTGCCCTCAGGTGCTGTGACAGGGTTAAATCCGCGTTGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc > 1:2357911‑M2/1‑136 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg > 2:4090581/1‑150 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg > 2:1120624/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGACATTGGGATAACACTGCCCGCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAACCGCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg > 1:3499190/1‑150 (MQ=255) gatcagcgCTGGCCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCACCTACATTGGGCTATCACAGCCCACAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTcc > 2:717414/8‑150 (MQ=38) gCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATACGCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg > 2:2670152/1‑150 (MQ=255) cgcTGACACAACTCCACCGGCCTCTTCGGGGTTAAACCCGATCCAAAATGGGTATAACCCGGCCATCTGTTGCTTTGCCTGGTTTAAATCCGCGTAGGCGGGGGTTCACCGGCTATGTGCCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAt < 2:1704713/150‑1 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATg > 2:4894674/1‑150 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCGACAGTGGGAGATCACGGCCCGCACGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGGAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCagc > 2:901282/1‑148 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCaag > 2:5139936/1‑148 (MQ=255) taTCCACCTTCAACGGCATGTTGGGGGGTAAACCCGCTCCTACTTGGGTATATCAGTGCCCTCTTGTGCTGGGACCGGTTCAAATCGGTTTTGGTGGGTTTTCACCCGCCATTTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCaa < 2:397907/149‑1 (MQ=255) gATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGGATAAAACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAACCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAACGCCACCCCATGCaa > 2:5153255/1‑150 (MQ=39) aTCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCgg > 2:347730/1‑98 (MQ=255) aTCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCgg < 1:347730/98‑1 (MQ=255) tCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCAGGTGCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATACGCGTAGGAGCGGGTTCACACGCGAATAGGCCGGGCCAGGTCGCCACAAGGCCACCCCATGCAAcc > 2:2221912/1‑150 (MQ=255) aCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGTCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAAGCCACCCATc > 2:5240611/1‑150 (MQ=255) cgggccTCTTGGCGGGTgaacccgctcctacgcgtatttcaccctgccactgcacctgagggcagttatatcccaatgtaggcgcggttttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcactt < 1:1225909‑M1/148‑134 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgcgggctgtgatatcccattgtcggagcgggtttccccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttg < 1:4295756‑M1/150‑135 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtcggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgca < 1:2260657‑M1/150‑137 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgca > 2:3710723‑M1/1‑14 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTgaacccgctccaacgcggatttaaccctgtcacagcacctgagggcagtgctataccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccaccacccgggtattcacttgca > 1:2357911‑M1/1‑14 (MQ=255) tctTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat > 1:5264721‑M1/1‑11 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcgc > 2:248345/1‑150 (MQ=255) agtgacagggtgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat > 2:1303443‑M1/8‑11 (MQ=255) agtgacagggtgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat > 2:1303270‑M1/8‑11 (MQ=255) agtgacagggtgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat > 2:1303444‑M1/8‑11 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg < 1:4199308‑M2/150‑68 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGccc > 2:2666875/1‑103 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTa < 1:62565/138‑1 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTa > 2:62565/3‑140 (MQ=255) gcgGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggca > 2:4440397‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggca > 2:4643962‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggca > 2:2372607‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggca > 2:492386‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcccc > 1:960664/1‑121 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc > 1:4195118/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTcc > 2:1267576/1‑150 (MQ=255) ggTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattc > 2:4206445‑M1/1‑3 (MQ=255) ggTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattc > 2:4206191‑M1/1‑3 (MQ=255) gTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattct > 2:2689022‑M1/1‑2 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc > 2:2632930/1‑150 (MQ=255) | TCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGC > NC_002947/2057798‑2058091 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |