| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2057943 | 117 (0.710) | 8 (0.060) | 5/236 | NT | 7.2% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 2058017 | 104 (0.720) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGG > NC_002947/2057870‑2058161 | aGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCac > 2:2689022‑M2/1‑148 (MQ=255) gAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacc > 2:4206191‑M2/1‑147 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:1994249‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:2372607‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:492386‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:4643962‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:4440397‑M2/1‑144 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 1:4502569‑M2/150‑10 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 2:2062518‑M2/1‑141 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 1:1330710‑M2/150‑10 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCaccctgtcact > 2:1303270‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCaccctgtcact > 2:1303444‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 1:5264721‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 2:2184882‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAAGACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 1:4701616‑M2/1‑139 (MQ=255) tgCAAGTGAATACCCGGGTGGTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGTATAGCACTGC‑CCTCAGGTGCTGTGACAGGGTTAAATCCGCG‑TTGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc > 1:2357911‑M2/1‑136 (MQ=255) tgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc > 2:3710723‑M2/1‑136 (MQ=255) tgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc < 1:2260657‑M2/150‑15 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg > 2:4090585/1‑150 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg > 2:4090581/1‑150 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTACATTGGGATATAACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGGCAGGGTGAAATACGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgccaagaggcccg < 1:1225909‑M2/150‑18 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑GAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg > 2:1120624/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACATTGGGATATAACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg > 1:3499195/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGACATTGGGATAACACTGC‑CCGCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAACCGCG‑TAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg > 1:3499190/1‑150 (MQ=255) gatcagcgCTGGCCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCACCTACATTGGGCTATCACAGC‑CCACAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTcc > 2:717414/8‑150 (MQ=38) gTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACAGTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGTAATCCGCG‑TCGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCccca > 2:232212/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg > 2:2670210/1‑150 (MQ=255) cgcTGACACAACTCCACCGGCCTCTTCGGGGTTAAACCCGATCCAAAATGGGTATAACCCGGC‑CATCTGTTGCTTTGCCTGGTTTAAATCCGCG‑TAGGCGGGGGTTCACCGGCTATGTGCCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAt < 2:1704713/150‑1 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCGACAGTGGGAGATCACGGC‑CCGCACGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑GAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCagc > 2:901282/1‑148 (MQ=255) gATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGGATAAAACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAACCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAACGCCACCCCATGCaa > 2:5153255/1‑150 (MQ=39) cAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACAGC‑CCACAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCCGGCAACCCa > 2:5145923/1‑150 (MQ=255) cAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑GAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCCACCCAGccccg > 2:5293021/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACATTGGGATATCACAGC‑CCTCAGGTGCAGTGTCAGGGTGAAATACGCG‑GAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAAGCACCCCCACCCCGACTgg > 2:3015375/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTTacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg < 2:4423290‑M2/150‑68 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg < 1:4199308‑M2/150‑68 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGccc > 2:2666875/1‑103 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGccc < 1:2666875/103‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCt > 2:1235359/1‑150 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTa > 2:62565/3‑140 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcccc > 1:960664/1‑121 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc > 1:4195118/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc > 2:4550621/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 2:4790675/1‑106 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTcc > 2:1267576/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCa > 2:432551/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCa > 1:2912342/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCa > 1:688630/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc > 2:2632930/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgc > 2:4199308‑M2/1‑74 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCtt > 2:1760542/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTa > 1:4156977/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGTCCTTTGGTATTTCCCGGC‑CCTCTGGTGCTGTGACTGGGTTAAAGCGGCG‑TTGGCGGGGGTTCCCCCGCTACGCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc < 2:3927753/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTTCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTaa > 2:74330/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcac < 2:1282835‑M2/150‑81 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc > 2:4602231/1‑150 (MQ=255) 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tCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgc > 2:4276818/1‑150 (MQ=255) cACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgct > 1:1265124/1‑150 (MQ=255) aCTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCACGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCAAGCTTCTACCTGTTCTATATCGCCctgctg > 1:3587316/1‑150 (MQ=255) cTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTgg > 1:306818/1‑150 (MQ=255) tGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTggg > 2:808665/1‑150 (MQ=255) c‑ccTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccatcaa < 1:1937208‑M2/150‑106 (MQ=255) tCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCca > 1:1901903/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCca > 2:3801611/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATcc < 1:3048744/95‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATcc < 1:3048631/95‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATcc > 2:3048631/1‑95 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATcc > 2:3048744/1‑95 (MQ=255) aGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcacc > 2:5417867/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgca > 2:3324365/1‑150 (MQ=255) tGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGtt > 1:3925308/1‑150 (MQ=255) tGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGtt > 1:5318905/1‑150 (MQ=255) ctggtttaaaTCCGCG‑TTGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCt < 2:4014549/143‑1 (MQ=255) tttaaaTCGGCG‑TTGGCGGGGGTCCCCCCGTTACGCGCCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg < 2:1449509/147‑1 (MQ=255) gTGAAATCCGCT‑TCGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGCCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg < 2:3499195/150‑1 (MQ=255) gtgaaTCCGGGTTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg < 2:3499190/147‑1 (MQ=255) tCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGGTCCTGGCGCTGTAc > 2:3271717/1‑150 (MQ=255) gcg‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 1:1490260/1‑150 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGacc > 1:1395950/1‑150 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGacc > 2:4515434/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGaccac > 1:517559/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGaccac > 2:4573007/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGaccac > 1:2280479/1‑150 (MQ=255) cGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTg < 2:1395950/150‑1 (MQ=255) | AGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCG‑TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGG > NC_002947/2057870‑2058161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |