| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
AAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCC > NC_002947/2713342‑2713637 | agaagCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTg < 2:3083414/150‑1 (MQ=255) gaagCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTgg < 2:4825434/150‑1 (MQ=255) gaagCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTgg < 1:2119096/150‑1 (MQ=255) 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aGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACATAGCCTGCGGGTGGGCGAAg > 2:4723292/1‑150 (MQ=255) gcgcAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTGGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGGCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGt < 2:3953507/150‑1 (MQ=255) gcAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTAc < 1:3511766/150‑1 (MQ=255) ttAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGccgcg < 1:3107103‑M2/150‑6 (MQ=255) aGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGa < 1:4696614/150‑1 (MQ=255) 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1:1345803‑M1/118‑93 (MQ=255) ccTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGt > 1:616392/1‑76 (MQ=255) ccTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTcc < 1:2168276/150‑1 (MQ=255) cTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGACCATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTGTCCt > 2:4620410/1‑150 (MQ=255) cTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCt > 2:2125177/1‑150 (MQ=255) gCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCa < 2:895520/150‑1 (MQ=255) ttCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCg > 2:1671127/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGAACGAAGACTCCGGGAACATCGCGAAGTGATCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCAGGATACACCGAAGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACACAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCg > 1:5011092/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCgg < 1:235565/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGccgctgacgaagtattttgccgtaggcaaggtcgacaaggaccagatcgagcgttacagcgcacgcaaaggccag < 2:3773267‑M2/97‑76 (MQ=255) cTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCa < 1:2535609/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGGGCGAAGTACCAGccgcaggcgaagtattttgccgtaggcaaggtcgacaaggaccagatcgagcgttacagcgcacgcaaaggccaggatatcagcgtgagcgagcgctggctggcgcctaacctggggtatgacagctaa < 1:3091203‑M2/150‑130 (MQ=255) gCGGctggtacttcgcccacccgcaggcgaagtattttgccgtaggcaaggtcgacaaggaccagatcgagcgttacagcgcacgcaaaggccaggatatcagcgtgagcgagcgctggctggcgcctaacctggggtatgacagctaaa > 2:3187860‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGGctggtacttcgcccacccgcaggcgaagtattttgccgtaggcaaggtcgacaaggaccagatcgagcgttacagcgcacgcaaaggccaggatatcagcgtgagcgagcgctggctggcgcctaacctggggtatgacagctaaa < 1:5352829‑M1/150‑147 (MQ=255) gCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAg < 1:584200/64‑1 (MQ=255) gCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAg > 2:584200/1‑64 (MQ=255) cGGctggtacttcgcccacccgcaggcgaagtattttgccgtaggcaaggtcgacaaggaccagatcgagcgttacagcgcacgcaaaggccaggatatcagcgtgagcgagcgctggctggcgcctaacctggggtatgacagctaaac < 1:5145695‑M1/150‑148 (MQ=255) | AAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCC > NC_002947/2713342‑2713637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |